
测序
zd200572
这个作者很懒,什么都没留下…
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Excel实现序列反向互补
最近有需求需要把很多excel里的引物序列反向互补,当然,任何一个编程语言都能解决,可是编个脚本需要一定的时间,而且,跨平台性也不足够好吧。Excel就不一样了,人人电脑里有,天天用,如果能做一些小工具也是很棒的事嘛。Excel也是“万能”的,哈哈。这里,我通过百度,挑战一下Excel的极限,用公式解决。首先声明,公式来源于网络,我只是把两个公式组合了一下。1.找到了互补序列的生成方法在下面注明的Excelhome论坛,有用户求助如何获得反向序列,有几个大牛分别拿出了几个公式,我用了其中的第二个,看着相原创 2020-05-10 13:12:16 · 4908 阅读 · 4 评论 -
纳米孔(Oxford Nanopore)测序仪的学习笔记
最近学习了测序中国探基学院的相关课程,关于纳米孔(Oxford Nanopore)测序仪,由诺禾致源的工作人员主讲,收获了一些知识,在此记录一下。他们讲的内容多了一些实践相关的经验,值得学习。关于纳米孔测序仪的性能指标1.准确度已经从R6试剂的70%提升到了现在的95%。 2.建库起始DNA量建议大于10微克。关于建库方式1D Ligation 1D + Barcode–损伤修复–...原创 2019-05-27 16:04:29 · 18332 阅读 · 0 评论 -
Nanopore牛津纳米孔测16S学习笔记
身处这样一个互联网时代,应当感恩技术带来的便利,从在一个地方不远游就只能是井底之蛙,到今天互联网让我们不出门知天下事,当然,假消息也有。虽然现在许多事和技能仍然需要项目实践,但是不得不说,知识已经不再是一种稀缺的资源,需要时间训练的技能才是。我们应该充分利用好这个时代提供给我们的便利,努力学习和思考。虽然川普四处设限,但是地球村依然变得越来越“小”,就拿我们生命科学领域来说,ncbi数据库,让...原创 2019-07-03 16:41:15 · 2365 阅读 · 0 评论 -
纳米孔Nanopore-16S数据分析学习笔记
1.下载原始数据本次学习分析的文章是这篇:https://academic.oup.com/gigascience/article/7/12/giy140/5202451这篇文章的原始数据有点问题,使用sra和ena数据库直接下载都基本上会失败,sra只能下到一个10M左右的数据,转换格式成fastq后只能获得4.6M的数据。最后使用aspera connect下载可以成功。命令如下,我是黑...原创 2019-07-03 16:42:44 · 2889 阅读 · 0 评论