[SimpleITK + python]sitk.show()与imageJ结合使用常见的问题

mostztzhang

于 2018-10-29 17:15:38 发布

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分类专栏：图像配准文章标签： sitk imageJ sitk.show

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本文介绍了在使用SimpleITK时遇到sitk.show()功能无法正常使用的问题，问题根源在于SimpleITK图像显示依赖于ImageJ。解决步骤包括：正确下载并安装ImageJ的特定版本，替换ImageJ中的文件，设置环境变量SITK_SHOW_COMMAND指向ImageJ的可执行文件，并在Path中添加该路径。按照这些步骤操作后，sitk.show()应该能正常工作。

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在python中配置simpleITK时，遇到了以下这个问题。

simpleITK已经通过pip install安装，但是sitk.show()功能无法正常使用，类似如下

实例代码

import SimpleITK as sitk
import sys
import os
example = sitk.ReadImage("filename")
sitk.show(example)

在sitk.show()这一步会出现以下错误

“Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in 
sitk.Show(image)
File "C:\Python27\lib\site-packages\SimpleITK.py", line 4158, in Show
return _SimpleITK.Show(*args, **kwargs)
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Show: ............\Build\ITK\SimpleITK-0.7.1\Code\IO\src\sitkShow.cxx:463:

sitk::ERROR: Error in administrating child process: [参数错误。]”

原因是SimpleITK的图像显示功能是通过类似ITK-snap