
MRI数据基于matlab及其工具包spm等的处理
文章平均质量分 68
Cynthia小阁
这个作者很懒,什么都没留下…
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BrainNet Viewer中选择不同模板的surface file所呈现的不同效果对比
BrainNet Viewer中选择不同模板的surface file所呈现的不同效果对比@TOCBrainNet Viewer中选择不同模板的surface file所呈现的不同效果对比BrainMesh_Ch2.nvBrainMesh_Ch2_smoothed.nvBrainMesh_Ch2withCerebellum.nvBrainMesh_ICBM152.nvBrainMesh_ICBM152_smoothed.nvBrainMesh_ICBM152_smoothed_tal.nvBrainMe原创 2024-07-15 14:25:25 · 932 阅读 · 0 评论 -
skull stripping
Try this code:clc; % Clear the command window.close all; % Close all figures (except those of imtool.)clear; % Erase all existing variables. Or clearvars if you want.workspace; % Make sur原创 2017-09-14 14:26:01 · 2519 阅读 · 0 评论 -
[spm操作] 什么是mask,如何做mask(未完)
本帖作为《用Matlab和SPM批量处理被试的经验总结》的一部分目录贴请见http://home.52brain.com/forum.ph ... =1&extra=#pid158525我在初学fMRI数据分析的时候常听到mask这个东西,但过了相当长一段时间才搞清楚了这是个啥东西。你在用SPM跑完数据分析之后会发现你的结果里面那一堆乱糟糟的东西里面有一个文件叫 mask.im转载 2017-11-29 19:22:43 · 20061 阅读 · 10 评论 -
[spm操作] 什么是ROI,如何做ROI以及批量提取ROI的%signal change的示例程序
本帖作为《用Matlab和SPM批量处理被试的经验总结》的一部分目录贴请见http://home.52brain.com/forum.ph ... =1&extra=#pid158525ROI (region of interest, 感兴趣区),顾名思义,就是研究者感兴趣的地方。通常在脑成像数据处理中,会把某些ROI中的信号提取出来,来和行为或是其它脑区数据做相关。做静息态的朋友转载 2017-11-29 19:24:08 · 27773 阅读 · 11 评论 -
[spm操作] VBM分析中,modulation的作用
本帖作为《用Matlab和SPM批量处理被试的经验总结》的一部分目录贴请见http://home.52brain.com/forum.ph ... =1&extra=#pid158525在VBM分析中,通常都有一个modulation的选项,有些滴友对这个步骤的作用有点不太理解。我先举一个例子(如下图),有大小两个箱子,分别装满了一定量的棉花。现在要你把一个箱子里的棉花取出来,转载 2017-11-29 19:25:10 · 2808 阅读 · 1 评论 -
[spm操作] 用SPM批量处理多个被试多个run的初步介绍
本帖作为《用Matlab和SPM批量处理被试的经验总结》的一部分目录贴请见http://home.52brain.com/forum.ph ... =1&extra=#pid158525 由于有些滴友不知道如何处理多个被试多个run的fMRI数据,只通过手动设置进行预处理和统计分析。对于简单的实验设计倒也罢了,如果实验设计较为复杂,操作起来就会非常麻烦,不但容易出错,而且效率低下转载 2017-11-29 19:27:32 · 14489 阅读 · 11 评论 -
mask制作,提取ALFF等指标 汇总
1.比如全脑的模板为mask,去掉几个不需要分析的脑区,该如何制作呢?静息态论坛里的视频第二部分“静息态功能磁共振数据处理视频教程(第二部分,中文版).flv”37:55左右介绍了:overlay下加载需要分区的模板比如:BA或ALL模板。之后在set range of threshold里面,Threshold value'range里:比如我需要BA20分区,则填写20,20。之后保存;如果只...转载 2018-03-12 20:54:54 · 16230 阅读 · 4 评论 -
脑部MRI图像灰白质分割以及体积测量方法
一, 研究背景脑组织形态学研究是临床判断脑组织的正常老化与病理过程的重要方法,近20年来,随着医学影像学的高速发展,临床医师对人体病变部位的观察更直接、更便捷、更清晰,疾病的确诊率也更高,使得脑组织形态学方法成为脑科疾病中重要的诊断方法。比如,通过人体小脑体积的变化来诊断癫痫、人体海马体体积的变化来诊断帕金森(PD)或者阿尔兹海默(AD)等。本文主要以海马体体积测量为例对现在的脑部体积测量方法进行...转载 2018-05-28 19:28:02 · 22821 阅读 · 15 评论