使用python写的调内参的简易程序

这篇博客介绍了一个使用Python编写的调内参程序,通过最小二乘法计算蛋白质浓度。内容包括如何根据灰度值进行内参调整,以及线性回归方程的运用。目前程序面向过程,适合手动输入数据,未来可扩展为读取文件自动计算。

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根据灰度值来推测调齐内参所需要的蛋白质浓度(以最简单的最小二乘法来计算):一开始上样的时候最好等体积上样(蛋白溶度调成一致)。确保每个样的上样体积一致。多做2个重复取平均值。然后采用灰度分析进行内参调整,从而调整之后的上样量。
自变量与因变量的一系列对应数据,(x1,y1),(x2,y2),(x3,y3),...(xn,yn),分别是已经做好的实验的蛋白质浓度和相对应的灰度值。Input,以数组来存储这些数据,然后的output就是根据最小二乘法得出的调内参的最适浓度。
假设存在和实际数据最拟合的函数,y=f(x),使得实际数据和理论曲线的离差平方和:∑[yi-f(xi)]^2(从i=1到i=n相加)为最小,一般我们假设是线性关系,以线性回归方程表示如Y= a0 + a1 X ;∑(X--X平)(Y--Y平)=∑XY--nX平Y平;∑(X --X平)^2=∑X^2--nX平^2;
当∑[yi-f(xi)]^2(从i=1到i=n相加)最小时,可用函数 φ 对a0、a1求偏导数,令这两个偏导数等于零。得到的两个关于a0、 a1为未知数的两个方程组,解这两个方程组得出:a0 = (∑Yi) / m - a1(∑Xi) / m ;a1 = [∑Xi Yi - (∑Xi ∑Yi)/ m] / [∑Xi2 - (∑Xi)2 / m)]
得到不同孔道对应的不同线性关系,然后我们可以选定一个我们需要的灰度值Y,反过来求解每个孔特定蛋白质的浓度Xi。

我目前只是弄出来最简易的,完全是面向过程的简易程序,需要一个个数据自己敲进去,然后再计算处理理论上想要调齐内参的蛋白质加样浓度;

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