使用R完成字符串的子字符串频率统计

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本文介绍如何在R中利用strsplit函数进行字符串子串的频率统计，以实例展示了计算'a*g'间有0-5个任意字母出现的频率。

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整理自统计之都论坛


方法一   使用strsplit函数

a <- "aggcacggaaaaacgggaataacggaggaggacttggcacggcattacacggagg"
b <- strsplit(as.character(a),"ag")
length(b[[1]]) - 1  ##子字符串"ag"的出现个数

方法二   使用正则式函数 

a <- "aggcacggaaaaacgggaataacggaggaggacttggcacggcattacacggagg"
b <- strsplit(as.character(a),"ag")
regexpr("ag",a)
gregexpr("ag",a)
gregexpr("a.g",a)
attr(gregexpr("a.g",a)[[1]], "match.length")   #提取子模式长度

方法三  使用str_count函数 

library(stringr)
str_count("1212345", c("12", "23", "00"))


一个使用实例

计算a*g中间有0-5个任意字母的频率

library(stringr)
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