单细胞多组学:解析癌症的新视角
1. 单细胞基因组学和转录组学助力克服耐药性
单细胞多组学借助下一代测序技术和现代计算生物信息学分析,为深入理解癌症生物学和病理学提供了有力支持。这类研究在识别癌症相关信号通路以及开发新型治疗方法方面具有至关重要的作用。
最初由Tang等人发表的相关技术,随着时间推移,在细胞捕获方法和文库制备技术上取得了显著进展。通过单细胞全基因组和全外显子组测序的测序数据集,人们对基因异质性进行了广泛研究。随着单细胞测序技术的不断改进,研究肿瘤克隆群体变得更加容易。
单细胞多组学能够对单个细胞的转录组、基因组和甲基化组进行研究。例如,Hou等人的多组学研究利用该技术鉴定出了具有不同群体和转移潜能的两种肝细胞癌细胞克隆。此外,这些技术还被用于研究肺癌的肿瘤微环境(TME)以及免疫治疗耐药机制。Ma等人的一项研究利用单细胞RNA测序证实了肺腺癌中免疫反应相关基因的异质性,揭示了现代技术如何揭示相关的耐药机制。
2. 循环肿瘤细胞:单细胞分析的意义
2.1 循环肿瘤细胞的生物学特性
循环肿瘤细胞(CTCs)是从原发肿瘤脱落并进入血液循环的癌细胞,是肿瘤转移过程中的关键因素。在癌症进展过程中,肿瘤细胞通过上皮 - 间质转化(EMT)进入血管,这些循环细胞再通过间质 - 上皮转化(MET)离开循环并在继发部位定植,从而引发转移。
2.2 CTCs在癌症研究中的应用
- 作为生物标志物 :研究主要集中在CTC的分离和富集方法上,并观察到CTC数量与临床预后之间的相关性。在多种实体瘤中,CTCs已被报道可作为诊断、预后
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