16、基因组学与蛋白质组学中的机器学习技术

基因组学与蛋白质组学中的机器学习技术

1. 基因组学中的无监督技术

1.1 实验数据集

在基因组学的研究中，有多个不同的数据集被用于评估相关技术。以下是这些数据集的详细信息：
| 数据集名称 | 组织 | 总样本数 | 类别数 | 每类样本数 | 总基因数 |
| — | — | — | — | — | — |
| Alizadeh - v2 | 血液 | 62 | 3 | 42, 9, 11 | 2093 |
| Alizadeh - v3 | 血液 | 62 | 4 | 21, 21, 9, 11 | 2093 |
| Armstrong - v1 | 血液 | 72 | 2 | 24, 48 | 1081 |
| Armstrong - v2 | 血液 | 72 | 3 | 24, 20, 28 | 2194 |
| Bredel | 大脑 | 50 | 3 | 31, 14, 5 | 1739 |
| Chen | 肝脏 | 179 | 2 | 104, 75 | 85 |
| Chowdary | 乳腺、结肠 | 104 | 2 | 62, 42 | 182 |
| Dyrskjot | 膀胱 | 40 | 3 | 9, 20, 11 | 1203 |
| Garber | 肺 | 66 | 4 | 17, 40, 4, 5 | 4553 |
| Golub - v1 | 骨髓 | 72 | 2 | 47, 25 | 1877 |
| Golub - v2 | 骨髓 | 72 | 3 | 38, 9, 25 | 1877 |
| khan | 多组