UVa1368：DNA序列（DNA Consensus String）

最新推荐文章于 2021-12-30 15:07:01 发布
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本文介绍了一种解决UVa1368问题的方法，即找到与一组DNA序列Hamming距离之和最小的DNA序列。通过分析每列出现次数最多的字符并考虑字典序，可以得到最优解。在编程实现中，需要注意DNA序列的字典序排序，以及在处理字符时区分单个字符和字符串的表示。示例中给出了5个DNA序列的最小Hamming距离解TAAGATAC及其计算过程。

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题目：

输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量 小。 两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的 Hamming距离为2（左数第1, 4个字符不同）。输入整数m和n（4≤m≤50, 4≤n≤1000），以及m个长度为n的DNA序列（只包含字母 A，C，G，T），输出到m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。 如有多解，要求为字典序最小的解。 例如，对于下面5个DNA序列，最优解为：TAAGATAC。

TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT

Sample Input：

3 
5 8 
TATGATAC 
TAAGCTAC 
AAAGATCC 
TGAGATAC 
TAAGATGT 
4 10 
ACGTACGTAC 
CCGTACGTAG 
GCGTACGTAT 
TCGTACGTAA 
6 10 
ATGTTACCAT 
AAGTTACGAT 
AACAAAGCAA 
AAGTTACCTT 
AAGTTACCAA 
TACTTACCAA

Sample Output：
TAAGATAC 
7 
ACGTACGTAA 
6 
AAGTTACCAA 
12

注意事项：

1.C/C++语言可以使用#define和const创建符号常量；而使用enum枚举类型不仅能够创建符号常量，还能定义新的数据类型。使用enum枚举类型的步骤如下：
（1）枚举量的声明和定义

enum enumType {Monday, Tuesday, Wednesday, Thursday, Friday, Saturday, Sunday};

这句话有两个作用：

第一：声明enumType为新的数据类型，称为枚举(enumeration);

第二：声明Monday、Tuesday等为符号常量，通常称之为枚举量，其值

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渐远霓虹
08-25 692
输入m个长度为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的Hamming距离为2。 输入整数m和n，以及m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。如有多解，要求为字典序最小的解。例如，对于下面5个DNA序列，最优解为TAAGATAC。 TATGATAC TA
UVA1368 DNA序列 DNA Consensus String 题解
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题意翻译 输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，如ACGT和GCGA的Hamming距离为22（左数第11、44个字符不同）。 输入整数m和n（4≤m≤50，4≤n≤1000），以及m个长度为nn的DNA序列，（只包含字母A、C、G、T），输出到m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。如有多解，要求字典序最小的解。 输入输出样例 Sample Input 3 5 8 TA
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题意：输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串Haming距离等于字符不同位置个数，例如，ACGT和GCGA的Hamming距离为2（左边第1，4字符不同）。 题解：用一个二维数组存输入的DNA序列，求出数组每一列出现最先次数最多的字符，这些字符的组成序列就是所求的DNA序列，Hamming距离，每一列与出现最多的字符不同的个数之和...
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01-18 146
这题的话，我们每次统计的话，是以列为外层循环，以行为内层循环，逐一按列进行比较。 统计完了之后，题目中要求说到要hamming值最小的，那我们就选用该列最多的字母就可以了，如果有数目相等的字母，那就按照字典序，选用字典序小的。 所以我们可以一层循环，挑选倒着挑选最大的值，如果大于等于就修改值，因为我的比较数组里是按照ACGT排列的，所以这样...
UVa1368-DNA Consensus String-DNA序列
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题目链接https://vjudge.net/problem/UVA-1368 输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的Hamming距离为2（左数第1, 4个字符不同）。 输入整数m和n（4≤m≤50, 4≤n≤1000），以及m个长度为n的DNA序列
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题目描述：输入m个长度均为n的DNA序列，求一个DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量 小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的 Hamming距离为2（左数第1, 4个字符不同）。 输入整数m和n（4≤m≤50, 4≤n≤1000），以及m个长度为n的DNA序列（只包含字母 A，C，G，T），输出到m个...
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紫书习题3-7 DNA序列（DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368） 输入m个长度均为n的DNA序列，求一个 DNA序列，到所有序列的总Hamming距离尽量 小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数，例如，ACGT和GCGA的Hamming 距离为2（左数第1, 4个字符不同）。 输入整数m和n（4≤m≤50, 4≤n≤1000），以及 m个长度为n的DNA序列（只包含字母A，C，G， T），输出到m个序列的Hamming距
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03-16
DNA共识序列是指在多个DNA序列中，出现频率最高的碱基在每个位置上的组合。它是一种基于多序列比对的方法，用于确定DNA序列中的共性和变异性。DNA共识序列可以用于研究基因组结构和功能，以及分析DNA序列的进化和变异。
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