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原创 二分类交叉熵损失

二分类交叉熵损失(Binary Cross-Entropy Loss)是用于二分类问题的常见损失函数。它衡量的是模型输出的预测概率分布与真实标签之间的差异。1 二分类问题在二分类问题中,每个样本的目标输出是 0 或 1,表示样本属于某一类或另一类。例如,假设我们有一个分类任务,模型的输出是某个样本属于类别 1 的概率 :,而类别 0 的概率就是。

2025-04-03 17:46:44 347

原创 理解激活函数,多个网络层之间如何连接

如果不在两个层之间添加激活函数,模型将无法学习非线性关系,表现出像线性模型一样的局限性。LeakyReLU(0.2) 是一个激活函数,它的作用是对每一层的输出进行非线性转换。激活函数通常在神经网络中用于增加网络的非线性能力,使得网络能够拟合更复杂的函数。在神经网络中,LeakyReLU 会接收上一层的输出并对其进行变换,从而得到下一层的输入。让我们通过一个简化的例子来说明如何将 LeakyReLU 用在网络中。假设我们调用了 block(8, 4) 和 block(4, 2)。

2025-04-02 20:50:59 759

原创 【一篇文章搞懂继承】继承 nn.Module 创建简单神经网络

假设你要自定义一个简单的全连接神经网络(MLP),你需要继承 nn.Module 来实现。# 定义一个简单的神经网络super(SimpleNN, self).__init__() # 继承父类 nn.Module 的初始化方法# 定义网络中的层self.fc1 = nn.Linear(2, 4) # 第一层: 输入2维,输出4维self.fc2 = nn.Linear(4, 1) # 第二层: 输入4维,输出1维# 定义前向传播过程。

2025-04-01 22:43:52 326

原创 LaTeX快速学习指南——安装,模板,公式图片快速提取与注意事项

最近要交一个LaTeX版的课程作业,如何半天完成LaTex的安装和运用呢?

2025-01-17 20:47:38 923

原创 一篇文章讲懂艾伦脑图谱在做什么(原理,数据处理)

基因的表达水平通常通过测量特定基因转录出的mRNA的数量或由其编码的蛋白质的数量来评估。这是基因活性的一个重要指标,对于理解生物体的生理和病理过程至关重要。AllenHumanBrainAtlas(AHBA)是一个整合了大脑基因表达的多模态人脑图集,为研究者提供了免费的可视化和数据挖掘资源,使研究人员能够发现结构,功能和分子生物学之间的联系。

2025-01-17 20:40:48 1330

原创 医学影像学习记录 dparsf数据处理

医学影像入门#仅用来记录学习过程1.数据来源数据来源于http://www.rfmri.org/DemoData的样例数据,下载后文件夹中有DemoRaw和StatisticalDemo子文件夹,本文操作仅使用DemoRow>DemoData>FunRaw,T1Raw数据,将其整理为一个新文件夹Analysis。(D:\data\Analysis\FunRawD:\data\Analysis\T1Raw)数据格式要求将所有的数据放在一个文件夹中,并且所有被试的功能像数据和结构像数据

2025-01-17 17:15:45 3303 2

原创 GIFT ICA 下载记录

1.帮助文档GroupICA/IVAOffMRIToolbox;【GIFT介绍】GroupICAoffMRIToolbox(GIFT)WalkThrough;【流程介绍】GIFTv1.3cFunctionsSrinivasRachakonda,EricEgolfandVinceCalhoun【流程解释】

2025-01-17 17:14:46 2757 7

原创 String下载插件----解决新版本没有App Manager问题

通过Apps—App store—show App store----输入插件名字,比如我这里想要下载插件MCODE。或者,https://www.jingege.wang/2024/08/09/cytoscape-app/进入以下网址,但是按按钮没反应,这是因为需要采用科学的方法。String没有App manager。通过该网址所示的方法找到下载链接。

2024-11-28 15:55:46 360

原创 快速爬取微博关键词

微博分布式爬虫项目,简单容易上手。本文章还记录了如何爬取数据的去重,分词处理,后续如何画自定义的词云图等。

2024-11-23 16:57:50 1991 16

原创 将SNP rsID转为基因名的方法

将SNP rsID转为基因名的方法,包括在线网站和软件包两种方式,当要转换的基因很多时,需要用软件包会更方便,该包可以作为网站的接口,并提供了如何使用的例子

2024-11-09 21:37:20 820

原创 Git Bash快速处理超大文本文件

使用R,matlab,python等处理超大文本文件太慢,所以使用Git处理加快速度。Git是版本控制系统,可以跟踪文本文件的改动(txt文件),但Word文档,图片、视频这些二进制文件可以进行管理,但无法跟踪文件的改动,只能观察到文件的大小变化。打开Git,点击git bash here。

2024-09-28 10:45:08 628

原创 python快速保存变量到文件中(Pickle模块)

为了减少重复运行代码的时间,我们可以把运行过程中的一些中间变量保存到文件中,这样下次再跑代码直接加载变量就可以了。

2024-09-11 17:44:13 419

原创 理解线性混合模型

混合效应模型称为混合,是因为该模型可以同时对固定效应和随机效应进行建模,固定效应指的就是总体的平均水平,对平均趋势建模,随机效应对这种平均趋势在分组水平上(参与者或主题)建模。

2024-09-03 16:31:16 2159

原创 pandas详细用法指南(python)

pandas主要的数据结构是 Series (一维数据)与 DataFrame(二维数据)。Series (一维数据):可以是数字(整数、浮点数等)、字符串、列表,元组,字典等python对象。series的每个值都有一个索引,默认从0开始。具有不变性(创建后大小不变)。data可以是列表[1,2,3]可以是字符串可以是数组可以是字典,这种方式把索引指定为1,2,3。

2024-08-30 17:01:49 4689

原创 PowerPoint报错:上次启动时失败,以安全模式启动...

把mathtype在应用商店删掉,重新打开ppt就可以了,是由于插件的问题导致的。PowerPoint上次启动时失败,以安全模式启动…按了是和否都没有反应。

2024-08-27 17:13:51 1069

原创 BrainNet Viewer教程——大脑可视化

BrainNet Viewer包以及文章中所用到的代码和文件可以关注公众号【大脑探路者】回复【大脑可视化】下载。文章教程包括使用示例数据画节点图和边图,以及如何用自己的数据画节点图和边图。

2024-08-26 16:42:20 3582

原创 Neurosynth教程 (操作记录)

本次教程目的如下:导入进行基本分析所需的模块;从提供的文本文件中创建一个新的 Neurosynth 数据集对象;运行简单的基于术语的荟萃分析。

2024-08-19 10:12:23 996

原创 Neurosynth教程

文件包含同名文件的附加信息,即从截至 2018 年 7 月 Neurosynth 数据库中14371 篇文章的摘要中用 LDA 提取的 100 个主题集,生成关于。.npz文件是一个numpy格式的将多个数组存在一起的压缩文件,每个数组以字典的形式保存,LDA 主题模型以跨 “主题 ”的概率分布来描述文本,而 “主题 ”又是跨词汇的概率分布。#查看文件有[‘indices’, ‘indptr’, ‘format’, ‘shape’, ‘data’]数组。每一行代表每项研究,每一列代表不同特征的权重。

2024-08-17 17:11:15 1461 2

原创 简单的用ps画出渐变的条形图

如果是黄色条形图可以不用这么麻烦,不知道为什么蓝色条形图进行涂刷时会涂到选定区域之外的地方。2 选定想要渐变的横向条形图 : 选择→色彩范围 →点击蓝色区域 →确定。4 重复1,2步 框出蓝色条形图的区域,再选择→色彩范围→指定蓝色区域。5 选择柔边圆画笔 将前置颜色修改为想要渐变的颜色 并调整笔刷的大小。3 ctrl+j 将选定的条形图复制到新图层,将背景和原图层隐藏。如果是黄色的条形图,直接进行第1,2,5,6步骤就可以了。此步骤把蓝色区域的地方都选了出来 去除了图片中白色的区域。

2024-05-22 20:29:53 559 1

原创 Navicat突然连接不上MySQL

cmd中输入“services.msc”在窗口中,找到“MySQL”,右键打开。:Navicat突然连接不上MySQL。原因:mysql还没有启动。原因:mysql还没有启动。

2024-04-28 16:36:35 329 1

原创 pytorchGPU版本下载,解决torch.cuda.is_available()返回False的问题(CUDA11.6,python3.9)

import torch没有问题但是torch.cuda.is_available()此时返回的false,故进行以下操作

2023-01-12 15:32:59 1759

原创 R包caret安装

error: package or namespace load failed for ‘caret’ in loadNamespace(j = 1.6.2。解压文件夹glue’ 1.6.2后移动到~\R-4.1.2\library中。对所有需要更新的包进行如上操作。将需要更新的包删除重装,加载成功(●’◡’●)

2022-12-22 12:07:53 4520 1

原创 MATLAB打开太慢解决

matlab打开太慢

2021-10-20 20:29:10 741

原创 医学影像学习记录 知识点

医学影像入门#仅用来记录学习过程磁共振共像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)1.功能像数据 (Functional MRI,fMRI)结构像数据 (Structural MRI,sMRI)功能磁共振成像原理:1.功能磁共振成像是一种基于血氧水平依赖(BOLD)的方法,当局部脑皮质被刺激时,消耗氧和葡萄糖,局部耗氧量增加,血管变粗,血液流动增加,但局部脑血流量比耗氧量增加更快,前者氧含量降低,后者氧含量增加,综合起来氧含量增加,氧合血红蛋白(运输氧气)量高于脱氧血

2021-09-18 12:45:00 561

原创 医学影像学习记录 dparsf下载

医学影像入门 下载软件#仅用来记录学习过程1.下载spm122.下载dparsf或DPABIDPABI由DPARSF演变而来,需要提前下载好spm和matlab才能打开,下载DPABI的过程如下:下载地址:http://rfmri.org/dpabi安装步骤:将解压后的文件夹复制到matlab的toolbox文件夹下 D:\matlab\toolbox\DPABI_V6.0_210501,再打开matlab在设置路径中添加该新地址,输入dpabi进行调用3.数据准备(ADNI数据)数据格

2021-09-14 10:21:30 1767

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