实现TIMER源代码

最新推荐文章于 2024-12-08 18:36:12 发布

原创

最新推荐文章于 2024-12-08 18:36:12 发布 · 1.1k 阅读

1 ·

CC 4.0 BY-SA版权

要求：下载TIMER 源代码（CancerImmunePipeline.R），并以一种癌型数据为例，实现源代码，并获得Fmat结果

一、获取源代码

1.1 在NCBI上找到TIMER相关文献

在这里插入图片描述

1.2 往下滑找到source code并下载

在这里插入图片描述
下载完成

二、准备需要的数据集

2.1 通过GDAC firehose获取RNA-seq或Affymetrix阵列分析的基因表达数据

2.1.1 GDAC firehose下载数据
进入GDAC firehose
点击进入GDAC firehose
进入下载网址
点击下载

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