实现TIMER源代码

最新推荐文章于 2024-07-09 20:49:42 发布

天不怕地不怕只怕代码

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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/yayiling/article/details/116065385

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要求：下载TIMER 源代码（CancerImmunePipeline.R），并以一种癌型数据为例，实现源代码，并获得Fmat结果

一、获取源代码

1.1 在NCBI上找到TIMER相关文献

在这里插入图片描述

1.2 往下滑找到source code并下载

在这里插入图片描述
下载完成

二、准备需要的数据集

2.1 通过GDAC firehose获取RNA-seq或Affymetrix阵列分析的基因表达数据

2.1.1 GDAC firehose下载数据
进入GDAC firehose
点击进入GDAC firehose
进入下载网址

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