
bioinformatics
Yaopufu
这个作者很懒,什么都没留下…
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使用python 对网页上的数据进行爬取
f=open('wangye0.txt','r',encoding='utf-8')k=open('seq0.txt','w')seq_list=[]for line in f: if '<TD vAlign=center align=left width="55%" bgcolor="#FFFFFF"> <a name="target_seque...原创 2019-10-23 20:20:28 · 575 阅读 · 0 评论 -
biosequence analysis using profile hidden Markov models(使用隐马尔可夫模型分析序列)
官方网址下载工具后,按照网站上提供的文件来安装HMMER is used for searching sequence databases for sequence homologs, and for making sequence alignments. It implements methods using probabilistic models called profile hidde...原创 2019-10-23 18:04:39 · 613 阅读 · 0 评论 -
clustalo(Ω)Linux的安装及最简单使用命令
sudo apt-get install clustalo#测试使用 which clustalo 得到反馈为相应路径即代表安装成功#下面是运行代码 通过 clustalo -h 查看帮助文档得出clustalo -i 多序列比对文件 -o 比对完文件的文件名 --outfmt=st #(这是一种格式 还有别的比对文件格式可以查看clustal的官方网站 )这样就不会有4M大小和400...原创 2019-10-21 20:49:20 · 3862 阅读 · 0 评论