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PCA作为常见的一种聚类分析方法，在很多SCI论文中均有出现。

相关性热图绘制教程（origin绘制！无需R语言）相关性热图在很多文章中都有出现，一般都是使用R语言进行绘制。在origin中也可以进行同样的绘制，详细过程如下：实例解读这个数据是来源于R中的一个汽车相关的数据库，例如有关hp（马力）和disp（距离）这类性质。在该图第一行第一列的蓝色方框表示汽车的“mpg”属性和“mpg属性”之间的相关性为1，用蓝色和最大的方框表示。第一行第二列的的红色方框表示汽车“cyl”属性和“mpg”属性之间的相关性为~0.7，用浅红色和稍微小一点的方框表示。以此类推，表示

Co-occurrence网络图绘制教程（附详细代码）

R语言之长宽数据转换之前计算物种和抗性基因之间的相关性的时候得了一些宽数据，如下，这里想把它转换为长数据。这里使用两种方法：Tidyr包中的gather函数data <- read.csv("R.csv")#这里直接读入数据第一列的数据直接也包含在了数据中，方便后续直接选定不进行聚合，结构如下图1R_long <- gather(R,key = "species",value = "value",-'x')#这里默认聚合的是所有的列名，聚合后命名为species，其他所有的数值被聚合

保姆级聚类热图绘制！（不用R语言！不用写代码！）现阶段主流热图用R进行绘制，然而部分专业例如环境专业的同学们基本不怎么会使用代码去得到自己想要的图形（当然也不排除有厉害的同学也是会的）。环境专业的老哥们用的最熟练的莫过于origin了，origin自带的绘图中也是有热图的模块的，但是并不能进行聚类热图的绘制，本篇博客主要内容为使用originpro绘制一张SCI论文插图级别的热图。数据：数据的解释大家看看图就可以明白，(●’◡’●)。步骤：启动originpro，导入数据对数据进行归一化在

问题：之前绘制一个热图的时候，发现导出pdf的时候居然不显示文字！但是导出png的时候又是是正常显示的。我就纳闷了，如图所示：csdn自带的编辑器不太会调整，各位见谅将就着看哈。原因：（手动狗头）我发现我代码里面设置了字体，然鹅我系统里面没有这种字体。pheatmap(fontfamily="Arial",fontsize = 6,fontface="italic")### 这个不是完整的代码，是出问题的原因Warning messages:1: In grid.Call(C_text

R语言之相关系数计算篇简介：在环境微生物类的文章中，经常出现计算物种与基因、基因与基因、基因与代谢物之间的相关系数的内容，在这个计算的基础之上再进行相关的可视化。例如相关性热图、网络图等等。文献中常出现的相关系数有Spearman、Pearson两种。案例：之间课题组一个师姐想代谢组学中代谢物与基因之间的相关性，共选择了95种代谢物，3313个相关基因，三个实验组一个对照组（每组三个生物学重复，共计12个样本）如下：[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-vw