Neurosynth元分析——认知解码工具,软件包安装以及使用

如上图所示。NeuroSynth 元分析感兴趣的区域沿功能连接梯度的24个认知术语分布情况。认知术语是按照它们沿着梯度位置的加权平均值排序的。感官加工术语位于顶部,其次是领域一般认知功能,然后是高阶抽象认知和记忆相关的过程。
NeuroSynth 基本简介
NeuroSynth(https://neurosynth.org)是一个针对fMRI研究进行元分析的网站平台,输入一个关键词(比如,焦虑),就可以得到与焦虑相关的大脑“激活”图,可以用于定义ROI。
基本原理
提取关键词,检查文章摘要里是否包含该关键词,比如"anxiety",如果文章摘要里包含该关键词,则该文章的内容与该关键词有关;
提取脑激活坐标,自动提取文章表格里的坐标信息;
对关键词和坐标进行统计分析,生成与关键词对应的“激活图”。
例子
在NeuroSynth网站上的"Meta-analyses"下的"Terms"界面输入自己感兴趣的关键词,比如"anxiety",就会得到如下图所示的脑图。
该脑图是基于449篇研究的元分析结果,在脑图上方"Studies"处列出了这449篇研究的具体信息。
脑图中每个体素数值(Z score)的大致意义是:如果一篇文章包含"anxi

NeuroSynth是一个fMRI元分析平台,通过输入关键词生成大脑激活图。基本原理包括关键词匹配、坐标提取和统计分析。用户可以在其平台上进行关键词元分析、主题分析、功能连接图生成等操作。安装Neurosynth包需要创建虚拟环境并安装依赖,如pandas 0.25.0,nilearn等,之后下载数据集进行使用。
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