neuromaps——多模态、多尺度脑科学数据综合分析的利器 的使用

neuromaps是一个Python工具箱,用于处理和分析多模态、多尺度脑科学数据。它支持多种标准坐标系之间的转换,如MNI152、fsLR、fsaverage和CIVET。工具箱包含了丰富的大脑图和annotations,方便研究人员进行数据获取和分析。通过fetch_atlas()和fetch_annotation()函数,用户可以便捷地下载和获取数据。转换功能如mni152_to_XXX和XXX_to_YYY允许在不同空间之间转换数据。

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简介

神经图谱旨在提供一套可复制的工具,用于处理和分析大脑地图(或“注释”)。

作者介绍了一个开放访问的Python工具箱,neuromaps,以使研究人员能够系统地共享、转换和比较脑图(图1)。neuromaps软件工具箱在neuromaps上可用,在PyPi、Zenodo上,它作为Docker容器存在,文档可以在GitHub页面上找到(https://netneurolab.github.io/neuromaps)。
在这里插入图片描述

总的来说,这些脑图代表了十多年的人类大脑绘图研究,并含有多种表型,包括基因表达的第一主要成分、36个神经递质受体PET示踪图像、葡萄糖和氧代谢、脑血流量和容量、皮质厚度、T1加权/T2加权MRI比、六个典型MEG频带、内在时间尺度、进化扩展、三个发育扩展图、前10个功能连接梯度、主体间变异性和NeuroSynth衍生的第一个主成分认知激活。该数据存储库按标签组织,可以直接从neuromaps下载。

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