如何将fMRI 4D-nii文件转化为3D-nii文件

最新推荐文章于 2023-09-21 15:59:06 发布
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分类专栏： 神经科学工具箱 脑科学核磁共振成像 DPABI使用教材 文章标签： 核磁共振成像 图像处理
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/123854657
本文介绍了如何将4D-nii格式的fMRI文件转换为3D-nii格式。通过下载特定工具箱，设置输出格式为SPM8(3D NIFTI nii)，然后将4D-nii文件拖拽到工具箱中，即可完成转换。

如何将4D-nii格式转化为3D-nii格式

下面所放置的f3-c-sub001.nii为4D-nii文件，其为230个时间点。
在这里插入图片描述

1、首先下载工具箱，地址为：4D-nii格式转化为3D-nii格式

2、双击dcm2niigui.exe打开页面
在这里插入图片描述

第二步，点击输出格式（Output Format）为：SPM8(3D NIFTI nii)

在这里插入图片描述

第三步，把fMRI的4D-nii文件拖到打开的工具箱中即可完成格式的转换

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将fMRI D-nii文件转化为3D-nii文件
laugh666的博客
09-11 223
fMRI数据通常以D-nii（.nii）格式存储，其中包含了三维（3D）的图像数据和相关的元数据。然而，有时候我们需要将fMRI D-nii文件转化为纯粹的3D-nii文件。在这里，我们首先使用原始D-nii文件的头信息创建一个新的头信息副本。然后，我们更新新头信息的数据形状，将意图设置为’none’（表示没有特定的目的），并使用。数据的形状将是三维的（x，y，z，t），其中t是时间点的数量。完成上述步骤后，您将获得一个包含转换后3D图像数据的新的Nifti文件。函数将新的3D-nii图像保存到指定路径。
MRI学习笔记-MRIcron使用
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linly1219的博客
11-26 2021
下这一版，里面包括dcm2niigui.exe。
fMRI如何将4D-nii文件转化为3D-nii文件工具箱
03-29
fMRI如何将4D-nii文件转化为3D-nii文件工具箱。操作流程可参考博客：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/123854657 第一步，下载该工具箱，双击dcm2niigui.exe打开页面 第二步，点击输出格式（Output Format）为：SPM8(3D NIFTI nii) 第三步，把fMRI的4D-nii文件拖到打开的工具箱中即可完成格式的转换
【Fmri入门学习01】将fMRI 4D-nii文件转化为3D-nii文件
qq_46008620的博客
09-21 1535
mricron直接百度就可以下载，下载之后使用其中的dcm2niigui.exe做格式转换。原本的nii数据为4D格式，要选择时间点，有时放在MATLAB里面操作会报错。第一步：选择输出格式为SPM8（3D NIFIT nii）第二步：直接把要做格式转换的nii数据。直接点击ok后就可以转换了。
如何将4维的MRI数据变成3维
TOBIAS0924的博客
03-23 1726
问题： 在处理DCE或者diffusion数据时，我们常常会遇到四维MRI数据，下面是将其变成3维的方法 该方法主要基于MRtrix3库(需要科学上网) 具体描述：将会提取4维MRI数据中的第一个3DMRI数据，如果需要提取特定维度的3D还请参考官方文档 在 python上调用os.system 进行操作 import os os.system('mrconvert in.nii -coord 3 0 -axes 0,1,2 out.nii') ` ...
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05-16 731
【代码】python脚本实现批处理nii图像4D转3D
MRIcron下的4DNifti格式转变为3DNifti格式
ScarlettGuo的博客
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MRIcron下的4DNifti格式转变为3DNifti格式 本文为转载，原文链接：http://blog.sina.com.cn/s/blog_691f18960101jyuv.html 目前，脑成像数据主要有DTI、fmri、3D三种模态。这些数据在分析前都要进行格式转换，不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同。脑成像处理软件也很多，不同软件使用的格式也不一样，所以数据转换是脑成像数据处理的第一步，必须非常清楚。这里主要以siemens的机器为准，介绍在windowx下的MRIcron的dcm2nii转换和
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03-24 3016
dcm2nii这个函数是将医学图像中的dicom格式转换为nii格式的，但是要注意，如果我们想要更多的信息，比如说DTI，处理需要另外两个文件（bval和bvec）option就不能用o,而是应该用a dcm2nii -a filepath
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