如何将fMRI 4D-nii文件转化为3D-nii文件

最新推荐文章于 2023-10-17 22:06:34 发布
最新推荐文章于 2023-10-17 22:06:34 发布
阅读量3.7k 收藏 4
点赞数
分类专栏： 神经科学工具箱 脑科学核磁共振成像 DPABI使用教材 文章标签： 核磁共振成像 图像处理
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/123854657
版权
本文介绍了如何将4D-nii格式的fMRI文件转换为3D-nii格式。通过下载特定工具箱，设置输出格式为SPM8(3D NIFTI nii)，然后将4D-nii文件拖拽到工具箱中，即可完成转换。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

如何将4D-nii格式转化为3D-nii格式

下面所放置的f3-c-sub001.nii为4D-nii文件，其为230个时间点。
在这里插入图片描述

1、首先下载工具箱，地址为：4D-nii格式转化为3D-nii格式

2、双击dcm2niigui.exe打开页面
在这里插入图片描述

第二步，点击输出格式（Output Format）为：SPM8(3D NIFTI nii)

在这里插入图片描述

第三步，把fMRI的4D-nii文件拖到打开的工具箱中即可完成格式的转换

了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
fMRI如何将4D-nii文件转化为3D-nii文件工具箱
03-29
fMRI如何将4D-nii文件转化为3D-nii文件工具箱。操作流程可参考博客：https://blog.youkuaiyun.com/xj4math/article/details/123854657 第一步，下载该工具箱，双击dcm2niigui.exe打开页面 第二步，点击输出格式（Output Format）为：SPM8(3D NIFTI nii) 第三步，把fMRI的4D-nii文件拖到打开的工具箱中即可完成格式的转换
【Fmri入门学习01】将fMRI 4D-nii文件转化为3D-nii文件
qq_46008620的博客
09-21 1245
mricron直接百度就可以下载，下载之后使用其中的dcm2niigui.exe做格式转换。原本的nii数据为4D格式，要选择时间点，有时放在MATLAB里面操作会报错。第一步：选择输出格式为SPM8（3D NIFIT nii）第二步：直接把要做格式转换的nii数据。直接点击ok后就可以转换了。
如何将4维的MRI数据变成3维
TOBIAS0924的博客
03-23 1671
问题： 在处理DCE或者diffusion数据时，我们常常会遇到四维MRI数据，下面是将其变成3维的方法 该方法主要基于MRtrix3库(需要科学上网) 具体描述：将会提取4维MRI数据中的第一个3DMRI数据，如果需要提取特定维度的3D还请参考官方文档 在 python上调用os.system 进行操作 import os os.system('mrconvert in.nii -coord 3 0 -axes 0,1,2 out.nii') ` ...
python脚本实现批处理nii图像4D转3D
qq_45418939的博客
05-16 654
【代码】python脚本实现批处理nii图像4D转3D
MRIcron下的4DNifti格式转变为3DNifti格式
ScarlettGuo的博客
10-05 4335
MRIcron下的4DNifti格式转变为3DNifti格式 本文为转载，原文链接：http://blog.sina.com.cn/s/blog_691f18960101jyuv.html 目前，脑成像数据主要有DTI、fmri、3D三种模态。这些数据在分析前都要进行格式转换，不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同。脑成像处理软件也很多，不同软件使用的格式也不一样，所以数据转换是脑成像数据处理的第一步，必须非常清楚。这里主要以siemens的机器为准，介绍在windowx下的MRIcron的dcm2nii转换和
fmri如何将4d-nii文件转化为3d-nii文件工具箱
05-09
将4D-nii文件转换为3D-nii文件是fMRI数据处理过程的一部分，因为3D-nii文件适用于常用的神经影像分析软件包，如SPM和FSL。同时，将4D-nii文件转换为3D-nii文件可以减小空间资源的使用和计算机运算的负担。 为了将4D...
掌握fMRI工具：4D到3D-nii文件转换完全指南
由于在某些后续处理和分析中，可能需要使用3D-nii格式，因此了解如何将4D-nii文件转换为3D-nii文件变得尤为重要。 本知识点将详细解析如何使用一个专门的工具箱将4D-nii文件转换为3D-nii文件。该工具箱提供的用户...
如何使用fMRI工具箱将4D-nii格式文件转换为3D-nii格式，并确保数据的准确性和完整性？
最新发布
11-04
在进行fMRI研究时，文件格式的转换是一个常见的需求，尤其是当需要将4D-nii数据转换为3D-nii格式以便使用特定分析软件时。《掌握fMRI工具：4D到3D-nii文件转换完全指南》这本书能够为你提供详细的转换步骤和注意事项...
dcm2niigui.exe
03-12
转换图像格式的一种工具
脑成像数据的格式转换
06-28 9011
目前，脑成像数据主要有DTI、fmri、3D三种模态。这些数据在分析前都要进行格式转换，不同公司的扫描仪存储格式也不尽相同。脑成像处理软件也很多，不同软件使用的格式也不一样，所以数据转换是脑成像数据处理的第一步，必须非常清楚。这里主要以siemens的机器为准，介绍在windowx 下的MRIcron的dcm2nii转换和MRIConvert转换. 从扫描中心下载的原始数据是以dicom数据
NII 批量转换.py
06-10
这是NII格式批量转换的Python源码。下载解压后直接运行。
dcm2niix:dcm2nii DICOM到NIfTI转换器
04-29
关于 dcm2niix旨在将神经影像数据从DICOM格式转换为NIfTI格式。 该网页包含开发源代码包含Linux，MacOS和Windows的最新稳定版本的编译版本。 该软件的完整手册以的形式提供。 执照 该软件是开源的。 BSD许可证涵盖了大部分代码。 有些单位是公共领域（nifti *。*，miniz.c）或使用MIT许可证（ujpeg.cpp）。 有关更多详细信息，请参见license.txt文件。 依存关系 该软件通常应在macOS，Linux和Windows上运行，而无需任何其他软件。 但是，如果使用dcm2niix创建GZ压缩图像这将是，如果你已经快安装。 您可以通过下载获得针对您的操作系统编译的dcm2niix和pigz的版本。 图像转换和压缩 DICOM提供了许多存储/压缩图像数据的方法，称为。 有关如何启用不同选项以提供对更多格式的支持的详细信息。 基本代码包括对原始
dicom影像资料_将Dicom格式转换为Nifti文件方法1
weixin_39947306的博客
11-29 5279
将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1我们要做影像资料后处理分析，需要最常用到的软件是freesurfer、3D Slicer、spm12，但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件，因此我们需要把dicom文件转换成NIFTI格式(analyze格式)。有多种方法可以将Dicom格式转换为Nifti文件，今天为大家介绍一种比较简单的方法。PET，MR，CT等数据都可以用这种方法...
实现脑影像多个3D .nii文件到4D格式的转换
lala_feigongju的博客
09-09 2677
脑影像3D to 4D格式转换
使用dcm2niix将dicom文件转为nii.gz格式
热门推荐
u014776464的博客
05-11 1万+
前言 在使用私有的数据集进行深度学习工作时，往往需要对dicom数据序列进行预处理。由于dicom文件格式的多样性，在原始的数据下进行诸如查看和打标签的工作变得困难。 本文将介绍如何使用dcm2niix这个工具进行dicom到nii.gz格式的转换。 测试环境：Windows10 + python3 工具准备 可以直接下载工具包，选择相应的系统版本即可： https://github.com/rordenlab/dcm2niix/releases 也可以使用MRIcroGL 中集成的dcm2niix工具，两
linux-dcm2nii处理DTI dicom转nii,获得bval和bvec
weixin_37724055的博客
03-24 2898
dcm2nii这个函数是将医学图像中的dicom格式转换为nii格式的，但是要注意，如果我们想要更多的信息，比如说DTI，处理需要另外两个文件（bval和bvec）option就不能用o,而是应该用a dcm2nii -a filepath
使用win10来运行医学图像预处理中.sh文件和代码中dcm2nii的使用问题
qq_43243539的博客
10-17 355
dcm2nii命令是一个公司的老版本用的，可以去https://www.nitrc.org/frs/?group_id=152下载2016年版本里的文件。解压后会有一个dcm2nii.exe文件，我是win10系统，用pychram运行.sh文件需要下载git。网上教程一大堆就不说了 全程默认下载即可。将下载安装后的git集成到pycharm（网上都有 不说了，注意路径加上双引号）。想在pycharm的终端里运行.sh 需要将文件中第一行#!bin/bash注释掉，要不报错。
医学影像：静息态fmri数据的预处理
Spuer_Tiger
05-03 1万+
本文主要详细介绍了静息态fmri数据的预处理，什么是静息态功能核磁共振，以及从理论部分到实践部分，深度地讲解记录其中的细节，内容中的截图源自于暑期天津医科大学的功能项脑影像培训班，本文仅供学习参考，如有侵权，联系后将立即删除。
评论 4
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

sta@ma@brain

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值