R语言做统计检验绘图如何添加p-value和显著性标记？——详细介绍如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记？

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在R语言在生物信息学的实际应用中，常常需要添加p-value和显著性标记。很多同学对于添加P-value这个问题一直一知半解，殊不知，不同的类型添加P-value选择的方法也是不同的。

本文将详细介绍如何通过ggpubr包为ggplot图添加p-value以及显著性标记。利用数据集ToothGrowth进行演示。

#先加载包
library(ggpubr)
#加载数据集ToothGrowth
data("ToothGrowth")
head(ToothGrowth)

## len supp dose
## 1 4.2 VC 0.5
## 2 11.5 VC 0.5
## 3 7.3 VC 0.5
## 4 5.8 VC 0.5
## 5 6.4 VC 0.5
## 6 10.0 VC 0.5

比较方法

R中常用的比较方法主要有下面几种：

各种比较方法后续有时间一一讲解。

添加p-value

主要利用ggpubr包中的两个函数：

• compare_means():可以进行一组或多组间的比较
• stat_compare_mean():自动添加p-value、显著性标记到ggplot图中