DPABISurf的安装及使用(windows系统)

最新推荐文章于 2025-04-26 09:33:28 发布
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分类专栏： DPABI使用教材 文章标签： docker linux
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本文详细介绍了在Windows系统中安装DPABISurf的步骤，包括启用Hyper-V，下载并安装Docker，配置Docker的内存和磁盘共享，从百度网盘获取dpabi50docker.tar.gz文件，注册FreeSurfer并获取license.txt，以及验证安装成功的测试。遇到问题可参考哔哩哔哩上的DPABISurf安装指南。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

DPABISurf的安装及使用(windows系统)

STEP1: 在Windows搜索框中输入Hyper-V，进入Hyper-V管理器。设置虚拟硬盘和虚拟机的位置为D盘或其他非系统盘，并重新启动电脑。

Hyper-V虚拟硬盘设置​​​

STEP2: 点击 DPABISURF 1.1 ,如下图所示，从而进入界面。

DPABI界面

STEP3:点击Install，进行官网下载和安装Docker。

ST

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DPABISurf使用教材
从事脑科学核磁共振方法学研究，在Nature communications等权威期刊发表研究论文，熟练掌握磁共振处理方法和统计学方法，欢迎大家和我交流。
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DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤
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DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤 下载地址：http://rfmri.org/dpabi 安装步骤如下： 把文件夹进行解压，拷贝到MATLAB的toolbox下，在MATLAB的路径设置中添加DPABI的子文件夹，然后在命令窗口中输入“ dpabi ”进行调用。 DPABI是GNU / GPL *工具箱，用于脑成像的数据处理和分析，是从DPARSF（静止状态fMRI的数据处理助手）演变而来的，包含DPABISurf 和BrainImageNet。在MATLAB的路径设置
DPABI 的下载与安装
learner_jj的博客
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下载并在Matlab中成功安装fMRI处理工具DPABi
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yuzhounh的专栏
04-26 340
用户需根据实验设计调整参数，并通过QC指标确保数据可靠性，为后续统计分析奠定基础。- **质量控制**：排除头动过大被试（平移>2-3 mm，旋转>2-3°），计算帧位移（Frame Displacement, FD）和平均FD（阈值通常为FD < 0.2-0.5）。- **参数设置**：需输入重复时间（TR）、层数（如32层）、扫描顺序（如隔层升序/降序），并指定参考层（通常为中间层）。- **配准与分割**：将T1像与功能像配准，分割为灰质（GM）、白质（WM）、脑脊液（CSF），用于后续去噪。
DPABI安装教程
qq_42356925的博客
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DPABI是是中科院心理研究所严超赣老师团队开发的一款磁共振脑影像数据分析工具包。基于SPM，在安装DPABI之前需要安装好SPM，才能正常使用。SPM的安装方法见文matlab2021a版本条件下安装spm_kidllll的博客-优快云博客 1、下载安装包 下载地址：DPABI: a toolbox for Data Processing & Analysis for Brain Imaging | The R-fMRI Network 2、将下载好的dpabi文件夹移动到matl..
在docker环境下安装dpabi
qq_40181639的博客
07-28 999
以前都是在matlab中运行dpabi，matlab安装起来很麻烦，而且安装包很大，我现在用的版本已经有20g，在换电脑的时候重新安装一遍matlab都要小半天。遗憾的是在今年6月份的时候docker官网墙了，所以我的docker环境配置也是用别人安装包装的。2.docker镜像在官网就可以下，有百度云链接，如果docker可以直接通过pull抓下来，毕竟百度云的速度真的不一般。安装过程很简单，官网写的也很明白，会写这篇是因为不太熟悉很多软件，导致安装过程出现了很多小问题。不再多说废话了，开始安装流程。
DPABI下载安装、测试及部分问题汇总
qq_43419761的博客
11-08 1万+
以后研究自闭症谱系障碍（ASD），为此学习使用DPABI对fMRI数据进行分析，本篇博客记录DPABI的安装以及运行过程中遇到的问题。 严老师官方教程：The R-fMRI Course bilibili转载的过往教程：rs-fMRI原理与数据分析,DPABI教程 虚家峰老师的基础教程：静息态功能性磁振影像分析操作 Resting-State fMRI analysis in anction 虚家峰老师的主页：磁振影像原理與臨床研究應用 下载软件 第一步我们需要到严老师创建的论坛里下载DPABI：http:
linux dpabisurf安装使用
02-24
为了在Linux系统中安装并使用DPABISurf，需先准备必要的软件包和支持工具。确保已安装MATLAB版本不低于R2014a，并且拥有SPM12及其依赖项[^1]。 #### 准备工作 - 更新现有软件库至最新状态。 - 安装FSL用于处理神经...
dpabisurf
04-01
- **MATLAB 版本兼容性**: 确认使用的 MATLAB 版本满足最低要求（通常是 R2014a 及以上版本）。 - **SPM 配置**: 下载并解压对应版本的 SPM 至指定目录。 - **FreeSurfer 支持**: 如果计划进行表面渲染，则需要预先...
基于DemoData的DPABI首次运行及SPM安装
learner_jj的博客
04-09 1133
记录首次运行dpabi的过程和坑
大无语！！记录一下mac dpabi 安装报错：未定义函数或变量 ‘dpabi‘。Chrome浏览器！！！
weixin_44669441的博客
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先说结论，把dpabi50docker文件添加到Matlab路径下报错，未定义函数或变量 ‘dpabi’。原因是。。docker不等于 dpabi，下错文件了。 真正的文件名是DPABI_V5.0_201001（或类似）。很有可能是浏览器把弹窗屏蔽了。。所以下不下来。 去下载页面点击download，看是否有弹窗被屏蔽提醒，非常小，不明显。 下面是乌龙详情。。。 进官网下载dpabi页面如下，点击download会跳转到如下页面（下图），我以为要donate之后跳转，试了发现并没有。 回去上个页面（上图）
数据资产生态白皮书.pdf
11-27
数据的价值迎来了悄无声息却影响深远的革新，数据不再仅仅是宝藏或者石油这样直白的财富代表，而已经发展为水与空气一般重要的必需品。 与此同时，数据带来的基于和挑战也伴随左右。一方面，数据联通个人，企业与政府端，通过开放、流通等不同方式释放巨大价值，重塑个人生活方式与商业模式、产生了巨大的杠杆效应；另一方面，如同水与空气面临污染的威胁，数据也同样面临着权属不清、定价不明、使用不公等社会经济难题，以至于这一价值无可限量的资源难以真正触达需求。
DPABI是一个功能强大的基于MATLAB和Python的脑成像数据分析工具包，用于处理和分析功能磁共振成像（fMRI）数据
YOLOv6666的博客
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本文将介绍如何下载和安装DPABI的Python版本，并提供相应的源代码。为了能够在任何目录下使用DPABI，你需要将DPABI的安装路径添加到系统的环境变量中。打开终端（对于Windows用户，可以使用命令提示符或PowerShell），导航到解压缩后的文件夹（dpabi-xxx）。DPABI的Python版本是基于Python语言的，因此在开始之前，确保你的计算机已经安装了Python。请注意，本文提供的是DPABI的Python版本的安装步骤。至此，你已经完成了DPABI的下载和安装过程。
浅谈DPABISurf数点理解
clancy_wu的博客
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Volume空间的功能连接基本都明白了。 ROI to brain 定义一个ROI，做它与全脑的功能连接，那么取这个ROI的时间序列平均值，然后把这个平均值和全脑 体素做FC，这个ROI的值是1，其他体素的值就是相关性系数的值。这样我们就得到了全脑的R值。 统计的时候，把多个被试的全脑R值放进去，两组进行对比，每个体素的R值就会有多个被试那么多，所以经过统计，就能得到每个体素的t值。如下图： （未完待续） ROI与ROI的对比就更简单了。 取ROI_1的平均时间序列，取ROI_2的平均时间序列，把他们进行
Dpabi v.1.8 使用过程
qq_45745941的博客
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最近打算做一些脑功能相关的分析，采用dpabi这个软件，记录一下遇到的错误。首先是安装，就采用先安装spm12，在安装dpabi。记得关闭VPN，不然一直无法弹出界面，会一直卡在这里。
Linux运行DPABISurf过程记录（持续更新）
clancy_wu的博客
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在这里记录下我的台式机跑DPABISurf做功能脑网络分析的流程。 cpu：i7-11700k，内存：64g，平台：Linux20.04LST DPABIV6.0_210501，DPABISurf1.6 这次跑的数据不多，20个被试。 一、运行时间 开始时间：2021年10月10日16点46分 结束时间：2021年10月11日，23点59分 运行选项：DPABISurf Pipeline默认的所有参数，包括数据预处理，alff，reho，dc等等，没有Functional Connectivity。
DPABI详细使用教材——数据准备、预处理流程、数据分析流程
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严老师的官方教程：官网 DPABI(用于脑成像的数据处理和分析的工具箱)的下载和安装步骤,请参阅博客： 安装教材 DPABI版本：V4.3_200401 MATLAB版本：2018a 目录 一、数据准备 二、预处理 三、数据分析 四、关于预处理流程 五、其他设置 一、数据准备 （1）如果是数据的DICOM格式，整理成以下格式（注意文件夹的命名方式）： 如果觉得不是很清楚，可以在官网下载Demo数据（http://rfmri.org/DemoData），参照里面的文件格式进行整理即可。 （2）如果数据是.
DPABISurf报错汇总
clancy_wu的博客
09-26 6101
matlab 运行报错含有 file2mat 字样 原因：matlab的路径设置有错误。点开matlab的设置路径，要满足以下条件：删除掉REST文件夹，SPM需要添加文件夹（非文件夹及子文件夹），DPABISurf需要添加文件夹及子文件夹。 2.matlab 运行报错 error detected during running fmriprep, please check ! 原因：docker没有打开或者image文件未正常运行。 3.matlab报错字样 copyfile …error 原因：do.
走进脑计划（四）：linux下安装SPM、DPABI
clancy_wu的博客
06-27 6569
最近每天都在勤奋的敲代码。。。。慢慢的常用的linux command也背熟了。。。昨晚弄好来SPM、DPABI，最后再来一个AFNI，就基本结束了第一个阶段（软件熟悉与安装），下一个阶段就是看这几个软件的manual，以及网上别人的学习心得，整理整理。 有感兴趣的同学可以关注我，我绝对是事无巨细的把每一步都写上了。我这是针对没有任何基础的跟我一样的刚进这个领域的临床医学生，高手可以忽略。 以...
DPABI如何安装
04-09
<think>好的，用户询问的是DPABI的安装方法或指南。首先，我需要回顾提供的引用内容，看看是否有相关的安装步骤。 引用[2]提到了DPABISurf在Windows系统下的安装，包括下载dpabi50docker.tar.gz文件和使用Docker加载的步骤。这可能与DPABI的安装有关，但需要确认DPABI和DPABISurf的关系。通常，DPABISurf是DPABI的一个模块或扩展，所以安装方法可能有相似之处。 引用[3]提到下载DPABI的链接，但用户需要具体的安装指南。此外，引用[4]指出DPABI处理流程的步骤，但未涉及安装。因此，主要的安装信息可能来自引用[2]和引用[3]。 根据引用[2]，安装DPABISurf需要Docker，用户需要下载特定的压缩文件并加载到Docker中。这可能适用于DPABI的安装，但需要明确说明。同时，引用[3]提到DPABI的处理流程，可能涉及安装前的准备，如MATLAB环境，因为许多神经影像工具依赖MATLAB。 用户可能需要MATLAB环境，下载DPABI的安装包，并按照步骤配置。此外，Docker方式可能是一个替代方法，如引用[2]所述。需要分步骤说明两种安装方法：传统MATLAB安装和Docker安装。同时，注意提及系统要求和常见问题，如确保MATLAB版本兼容，路径设置正确，以及依赖项的安装。 还要检查是否有其他引用被忽略，但根据现有信息，引用[2]和[3]是最相关的。需要将信息整合，用清晰的结构列出步骤，并提醒用户注意事项，如系统要求、依赖项和常见问题解决。 最后，生成相关问题，如系统要求、处理流程、常见错误等，以帮助用户进一步了解。</think>### DPABI安装方法及指南 #### 一、传统MATLAB环境安装（推荐基础用户） 1. **系统要求** - 操作系统：Windows/Linux/macOS - 必须安装 **MATLAB R2013a 或更高版本**（DPABI基于MATLAB开发）[^3] - 建议安装 **SPM12**（需提前配置到MATLAB路径）[^3] 2. **安装步骤** - **Step1 下载安装包** 访问[DPABI官网](http://rfmri.org/dpabi)或GitHub仓库，下载最新版本压缩包（如`DPABI_V7.0.zip`）。 - **Step2 解压文件** 将压缩包解压至无空格路径（例如`D:\DPABI`），避免路径错误。 - **Step3 添加MATLAB路径** 启动MATLAB，通过以下命令添加路径： ```matlab addpath(genpath('D:\DPABI')); savepath; % 永久保存路径 ``` - **Step4 验证安装** 输入命令`DPABI`，若弹出图形界面则表示安装成功。 --- #### 二、Docker容器安装（推荐无MATLAB用户）[^2] 1. **下载Docker镜像** - 从百度网盘获取`dpabi50docker.tar.gz`（提取码：`6vep`）。 - **无需解压**，直接通过Docker加载： ```bash docker load -i dpabi50docker.tar.gz ``` 2. **启动容器** ```bash docker run -it --rm -v /宿主数据路径:/mnt dpabi:5.0 ``` 通过挂载卷实现数据交互，避免容器内数据丢失。 --- #### 三、关键注意事项 1. **依赖项检查** - 确保安装 **Java环境**（MATLAB运行依赖）。 - 若处理小鼠数据，需注意模板文件兼容性[^1]。 2. **常见问题** - **启动报错**：检查MATLAB路径是否包含空格或中文字符。 - **功能缺失**：确认是否加载了SPM12等必要工具包[^3]。 --- 相关问题
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