使用`phy`进行神经网络数据读取及可视化之开发环境准备

本文介绍了如何配置使用_phy_进行神经网络数据读取和可视化的开发环境。首先,通过下载安装Anaconda3创建特定环境,并在environment.yml文件中指定Python版本。接着,安装_phy_和_phycontrib_,激活环境并安装所需库。运行示例程序时,注意可能遇到的问题,如需在激活环境前全局安装某些依赖,以及协议版本不兼容等。另外,打开示例数据可能导致特定目录残留,需要清理后重新打开。

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  • 基本步骤:

    1. 下载并安装 anaconda3
    2. 安装环境,environment.yml里面需要配置环境name和python版本: conda env create -f environment.yml --force
    3. 安装phy和phycontrib,进入各自的目录执行:python setup.py install
    4. 激活并进入环境:activate phy-name
    5. 在新环境中安装phy和phycontrib: pip install phy phycontrib
    6. 运行示例程序:phy template-gui params.py
  • 几个暂不知道具体原因的坑:

    1. 必须在激活环境之前,在anaconda操作环境下安装phyphycontrib,否则会出现command not foundsupervisor module not found等问题,这似乎是anaconda的一个BUG,如果没有在环境外面安装phy和phycontrib,在环境里面安装的这两个东西会认为目前的环境是Linux,所以出现只有在Linux下面才有的supervisor模块
    2. 使用Anaconda2可能会出现cli:39 unsupported pickle protocol: 3这个错误,换成Anaconda3就好了,python2.7不支持这么高版本的协议,只能使用python3
    3. phy template-gui的示例数据打开后会生成
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