openbabel安装

最新推荐文章于 2025-06-25 09:04:50 发布
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分类专栏： 工具使用 文章标签： openbabel
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/wwwsec/article/details/42268101
本文详细介绍了如何使用yum命令安装必要的软件包，并通过git进行开源项目的克隆。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

yum install git cmake gcc g++ gcc-g++

git clone git://github.com/openbabel/openbabel.git

wget http://bitbucket.org/eigen/eigen/get/3.2.3.tar.bz2

tar xjvf 3.2.3.tar.bz2


autodock windows安装对接使用、vina安装；openbabel安装使用
weixin_42357472的博客
05-24 4879
参考：https://www.bilibili.com/video/BV1iy4y167jr?p=4 https://zhuanlan.zhihu.com/p/516949506 autodock下载（候选区与对接模块）： https://autodock.scripps.edu/download-autodock4/ MGLTools可视化下载（autodock可视化界面软件）： https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/ openbabel下载安装：
PLIP，openbabel安装避坑
weixin_45613751的博客
03-11 925
PLIP以及openbabel的安装：`安装PLIP踩过的坑有一台ubuntu服务器，安装PLIP直接使用pip install plip就成功了，另外台服务器使用opensuse 15.4系统，结果各种bug，最终花了一下午时间，在两台服务器上面分别正确安装了PLIP，特此纪念一下。
openbabel包的安装
Drug discovery
11-16 1690
就openbabel3.1.1成功了。
OpenBabel在Jupyter Notebook中的安装与使用问题解析
最新发布
gitblog_07082的博客
06-25 441
OpenBabel在Jupyter Notebook中的安装与使用问题解析 OpenBabel作为一款强大的化学信息学工具，其Python绑定在Jupyter Notebook环境中的安装有时会遇到模块无法导入的问题。本文将深入分析这一常见问题的成因，并提供多种解决方案。 问题现象分析 用户在Jupyter notebook中执行from openbabel import openbabel as...
openbabel 安装
weixin_40248634的博客
10-09 341
pip install 总是不成功，然后下载package 本地 python install 也不成功。
Open Babel下载安装
qq_39889473的博客
07-18 5755
OpenBabel是一个促进化学数据从一种格式到另一种格式的相互转换的项目——包括各种类型的文件格式。简而言之，OpenBabel是Babel化学文件翻译程序的免费开源版本。OpenBabel是一个旨在从Babel中断的地方接手的项目，它是一个跨平台程序和库，旨在在分子建模、计算化学和许多相关领域中使用的许多文件格式之间进行相互转换。OpenBabel包括两个组件，一个命令行实用程序和一个C++库。...
Open Babel的安装与使用
热门推荐
Dechin的博客
05-18 1万+
技术背景 Open Babel是化学领域常用的一个文件格式转换工具，它可以支持xyz的坐标格式、SMILES表达式、InChI表达式和mol以及mol2等格式之间的互相转化。比如说，你只有一个甲烷的SMILES表达式C，那么你就可以使用Open Babel将其转化成一个mol2文件，这样就可以用vmd等工具进行分子的可视化(参考这篇博客)。 OBABEL的安装 OBABEL的安装方式有两种，一种...
Open Babel-开源
04-27
下载的openbabel-2.4.1压缩包包含了该版本的源代码、编译脚本、文档和其他相关资源，用户可以根据自己的需求进行编译安装或进一步开发。 总的来说，Open Babel是一个不可或缺的工具，无论是对化学初学者还是高级...
openbabel安装教程
12-14
2. 安装依赖项：在继续安装OpenBabel之前，你需要确保系统已安装了一些必要的软件包，例如C++编译器、Make工具和一些开发库。这些依赖项因操作系统而异，因此请在OpenBabel的官方网站上查找适用于你系统的安装说明。...
openbabel-2.4.1-cp35-cp35m-win_amd64.whl
10-19
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openbabel安装及在python上实现文件格式批量转换
qq_44707928的博客
11-15 2963
openbabel安装及在python上实现文件格式批量转换
openbabel 安装 & 生成指纹方法
frank_haha的博客
12-01 803
我们可以通过两种途径将 openbabel fingerprint 转换成 1024 维 one-hot 向量。
python模块OpenBabel安装教程
2401_85863780的博客
11-09 1765
安装 Open Babel 通过.whl文件的方式与安装其他 Python 库类似。
【免费下载】 开源化学工具箱：Open Babel 安装与配置指南
gitblog_09493的博客
09-13 3087
开源化学工具箱：Open Babel 安装与配置指南 项目基础介绍 Open Babel 是一个强大的化学数据处理工具箱，旨在跨不同的化学数据格式进行通信。它是一款开源且协作的项目，允许任何人搜索、转换、分析或存储来自分子建模、化学、固体材料、生物化学等领域中的数据。这个工具集支持超过90种化学文件格式的读写与转换，从有机化学到无机化学，甚至包括生物信息学和核化学等广泛领域。Open Babel...
openbabel 3 以及 python openbabel 安装教程
MrXunの博客
09-01 1万+
软件简介 Open Babel 是一个化学工具箱，旨在讲化学数据的多种语言。这是一个开放的协作项目，允许任何人搜索、转换、分析或存储来自分子建模、化学、固态材料、生物化学或相关领域的数据。 安装环境 OS ：Redhat 6 gcc 4.4.7 （系统默认版本） 安装依赖库 可以先 跳过 该步骤，后续出现对应的问题再来重新安装 swig 4.0.1 （optional） 由于系统自带的 swig 工具版本太低，在安装时没法正确的识别新语法，故这里需要先安装 swig ，如果你执行 swig -versi
python生信库（opencadd、openbabel）安装与绘图
aiia18的博客
09-02 1599
openbabel\opencadd\pymol安装
Linux安装Openbabel
weixin_47880303的博客
07-24 1115
【代码】Linux安装Openbabel。
Open Babel 的使用说明
博客而已
05-30 6304
Open Babel是很好用的生化数据格式转换工具，有window和linux的版本，今天介绍linux版里的相关命令。
Linux（64位）下OpenBabel 2.4.1、python2.7和Ipython实战（二）
DrugAI
08-26 2383
多分子SDF格式分子文件分割为单个分子的sdf文件。 openbabel2.4、IPython、Python2.7
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