钱多多先森
春有百花秋有月,夏有凉风冬有雪。
若无闲事挂心头,便是人间好时节。
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【医学影像数据处理】nii、npz、npy、dcm、mhd 的数据格式互转,及多目标分割处理汇总
医学领域进行数据处理的DICOM、.nii、.npy、.mha、.npz,jpeg、png等格式。原创 2021-04-22 15:39:07 · 28820 阅读 · 75 评论 -
【医学影像数据处理】 Dicom 文件格式处理汇总一(数据转换原理)
DICOM 数据格式转换,遵循一定的转换标准。如何将-1000到1000的hu值,转换到0-255的像素空间,本文主要对这部分进行介绍原创 2023-08-15 17:01:09 · 4414 阅读 · 0 评论 -
【医学影像数据处理】 Dicom 文件格式处理汇总二(Python格式转换)
Dicom数据存储格式,是医学领域通用的数据传输形式,本文将围绕dicom与医学算法展开原创 2023-09-21 09:07:23 · 7986 阅读 · 7 评论 -
【医学影像数据处理】nii 数据格式文件操作汇总
nii文件格式,在对医疗数据处理的过程中,无处不在,是一个最最经常会遇到的。了解和操作nii文件,对其中可能遇到的问题有一些基础的了解,至关重要。但是,现在我更喜欢nrrd文件了,不知道你是否知道nrrd文件。原创 2024-04-04 21:04:36 · 4897 阅读 · 0 评论 -
【医学影像数据处理】 XML 文件格式处理汇总
xml文件的学习记录,对xml文件的格式和操作方式有个深入的了解原创 2023-10-27 18:20:52 · 857 阅读 · 0 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割1(综述篇)
深度学习中 Pytorch 框架的 3D 图像分割项目,项目背景为CT 肺部结节医学影像的分割任务,使用到的数据集是LIDC-IDRI,相信参考本文会对你在这个领域的任务有个较为深入的了解原创 2023-10-21 21:52:02 · 2580 阅读 · 4 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割2(基础数据流篇)
深度学习Pytorch 的3D医学影像分割任务,本文对基础数据读取类进行了构建。从中掌握数据构建的方法,以及在该方法下发现的问题,以供下一步改进原创 2023-10-21 21:59:43 · 1722 阅读 · 0 评论 -
【3D图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割3(3D UNet 模型篇)
3D UNet 模型的搭建,提供了思路,帮助你快速而全面的了解该模型,并通过预测试方式,了解模型情况原创 2023-11-03 08:08:11 · 8526 阅读 · 0 评论 -
【3D图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割4(优化数据流篇)
对上一篇数据流存在的问题进行分析和解决,构建新的数据形式,和可视化方法原创 2023-11-03 21:07:13 · 1333 阅读 · 1 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割5(训练篇)
对训练过程进行了整体的梳理,和对其中缺失的模型进行了补全。通过本篇文章,可以快速的将模型和数据部分串联成一个整体原创 2023-11-08 19:55:49 · 1988 阅读 · 0 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割6(数据预处理之LIDC-IDRI 标签 xml 标签转储及标记次数统计 )
对lidc-idri数据的预处理。尽管之前已经告知了一种处理方式,本文将采用更加易于理解的方式,对这部分数据进行处理原创 2023-10-28 19:33:16 · 2105 阅读 · 11 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割7(数据预处理之 resample 数据到 1mm 统一尺度)
luna16数据预处理的第二部分,到这部分也就完成了我们的设定的目标,得到了我们预先想要得到的数据原创 2023-10-31 08:11:10 · 1497 阅读 · 6 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割8(CT肺实质分割)
CT肺实质分割的方法汇总,对目前主流的肺实质分割方法进行了介绍和演示,相信通过本文,你能够快速的动手实践原创 2020-05-23 12:55:26 · 10101 阅读 · 21 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割9(patch 的 crop 和 merge 操作)
3D目标分割任务中的常用操作,patch裁剪和对裁剪后的patch进行组合。尤其是本系列VNet的推理inference阶段,强烈推荐原创 2023-05-07 15:47:57 · 4138 阅读 · 5 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割10(测试推理篇)
单个裁剪patch的预测是简单的,而本文将从crop和merge两个阶段,在预测推理中并到一起,更加的简洁明了原创 2023-11-08 20:03:41 · 1324 阅读 · 0 评论 -
【3D 图像分割】基于 Pytorch 的 3D 图像分割11(预测结果 Recall 和 FPAR 评估)
敏感度和平均一个检查有多少假阳性,是实际使用中,比dice系数更有代表性的指标。本文就对这一指标进行评估,完整介绍其中的每一步细节原创 2023-11-20 20:35:23 · 901 阅读 · 1 评论 -
【3D 图像分割】unetr_plus_plus(UNETR++、nnU-Net)系列数据处理理解汇总
3D分割数据规范化处理学习记录原创 2024-05-12 21:46:23 · 1554 阅读 · 0 评论 -
【3D 图像分类】基于 Pytorch 的 3D 立体图像分类1(基础篇)
深度学习2维到3维分类任务详解,包括数据、网络、训练和评估。通过本文的学习,对3维数据的处理,可视化和模型构建均有较为深入的理解原创 2022-06-13 21:22:34 · 8372 阅读 · 38 评论 -
【3D 图像分类】基于 Pytorch 的 3D 立体图像分类2(数据增强篇)
深度学习3D分类的视线,本文主要对数据流部分进行整理,函数名GetLoader。通过本文的学习,相信你就可以开始动手进行实践了。原创 2022-07-16 11:21:25 · 2919 阅读 · 6 评论 -
【3D 图像分类】基于 Pytorch 的 3D 立体图像分类3(LIDC-IDRI 肺结节 XML 特征标签 PKL 转储)
PKL文件转储,便于后续分类数据的整理原创 2022-01-06 18:41:02 · 3834 阅读 · 1 评论 -
【3D 图像分类】基于 Pytorch 的 3D 立体图像分类4(多人标注的结节立体框合并和特征等级投票)
多人背靠背标注后,对标注结果进行汇总统计处理原创 2023-11-20 20:54:50 · 964 阅读 · 1 评论 -
基于 MONAI 的 3D 图像分割任务1(数据增强可视化)
monai库在医学影像中的应用进行介绍,同时进行可视化与增强操作原创 2024-11-18 21:07:17 · 503 阅读 · 0 评论 -
基于 MONAI 的 3D 图像分割任务2(Brain Tumour 和 SwinUNETR 训练)
一个训练和评估的案例,包括了训练全部代码,可以直接参考原创 2024-11-18 21:09:02 · 403 阅读 · 0 评论 -
【BraTS】Brain Tumor Segmentation 脑部肿瘤分割1(数据篇)
BraTS2015数据官方网址:http://www.braintumorsegmentation.org/下载地址:https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/26367原创 2022-04-24 18:15:55 · 14107 阅读 · 4 评论 -
【BraTS】Brain Tumor Segmentation 脑部肿瘤分割2(UNet的复现)
1、复线unet2、构建训练数据流3、浅谈思路原创 2022-05-11 20:33:34 · 4361 阅读 · 6 评论 -
【BraTS】Brain Tumor Segmentation 脑部肿瘤分割3(构建数据流)
构建训练的数据读取流原创 2023-04-04 17:29:16 · 1112 阅读 · 5 评论 -
【BraTS】Brain Tumor Segmentation 脑部肿瘤分割4(损失函数)
UNet中常用损失函数的品析,包括Dice loss和Focal Loss原创 2023-04-21 20:36:11 · 726 阅读 · 2 评论 -
【乳腺超声、乳腺钼靶、宫颈癌、CT骨折】等项目数据调研,及相关参考内容整理汇总
本文作为一个项目调研笔记,方便更多需要的人可以参考。如果万幸你也在做同样的项目,那直接借鉴就可以了原创 2023-09-26 22:19:38 · 856 阅读 · 0 评论 -
【实战类】Hog SVM进行图像分类任务
Hog+SVM实现对特征的抽取,和类别分类原创 2021-12-25 20:38:24 · 4080 阅读 · 8 评论 -
SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation 气胸x光识别比赛数据处理
基于kaggle气胸X光比赛原始数据,对RLE气胸标注标签转储mask图和json标注可读文件,JPEG胸片图像。公开代码基于python,可用于后续的分类、检测、分割等等任务数据输入原创 2021-12-25 16:03:07 · 3692 阅读 · 17 评论 -
PaddlePaddle/PaddleOCR 中英文文字识别
1.准备工作GitHub地址:https://github.com/PaddlePaddle/PaddleOCR1.QUICK INSTALLATION:https://github.com/PaddlePaddle/PaddleOCR/blob/release/2.2/doc/doc_en/installation_en.md2.Quick start of Chinese OCR model:https://github.com/PaddlePaddle/PaddleOCR/blob/rel原创 2021-09-06 18:36:27 · 9359 阅读 · 8 评论