生信-软件
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收集并整理一些组学数据分析、更广义生信分析中所用到的软件,从安装到使用流程结合
颠倒的海德格尔
生信研在读,聚焦结构+AI+多组学,自学编程技能+深度学习新手中,数学低级爱好者,交流多多!
Note:Nothing is impossible!非一日之功也,戒骄戒躁!
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Alphafold实用指南—官网教程3
EBI alphafold培训最后内容原创 2025-11-22 21:45:36 · 664 阅读 · 0 评论 -
Alphafold实用指南—官网教程2
EBI alphafold培训系列2原创 2025-11-22 16:11:47 · 904 阅读 · 0 评论 -
AlphaFold实用指南—官网教程1
EBI关于alphafold的官网教程指南原创 2025-11-20 18:14:42 · 805 阅读 · 0 评论 -
使用Json文件批量执行Alphafold3 web server预测
alphafold3预测结构网页服务器的批量处理原创 2025-11-17 18:30:10 · 1055 阅读 · 0 评论 -
如何在序列水平上简单分析一个新蛋白质序列(novel protein sequence)
新蛋白质序列分析的一些想法原创 2025-09-05 20:48:05 · 996 阅读 · 0 评论 -
解析蛋白质三维结构-Bio3D R包
目测还是下游分析软件,上游还是得使用其他语言的分子动力学软件主力原创 2025-08-26 10:48:34 · 558 阅读 · 0 评论 -
结构生物信息学工具
一些结构信息学工具集锦原创 2025-08-25 22:21:50 · 181 阅读 · 0 评论 -
安装开源版pymol
安装开源pymol原创 2025-07-31 09:05:38 · 2004 阅读 · 0 评论 -
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gene id转换原创 2024-09-12 11:31:40 · 2336 阅读 · 0 评论 -
搭配PDB使用pymol
pymol的基本操作,其余要做的就是上手分子动力学的东西原创 2024-10-29 12:12:00 · 2116 阅读 · 0 评论 -
蛋白质晶体结构解析:软件下载-分析内容
蛋白质晶体结构解析工具,案例实操分析见下一篇博客原创 2024-12-24 16:55:38 · 4609 阅读 · 10 评论 -
pymol基础教程-2:
转载自: <http://pymol.chenzhaoqiang.com/intro/advanceManual.html#google_vignette>转载 2024-12-27 10:37:43 · 2142 阅读 · 0 评论 -
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奇美拉以及pymol的一些尝试原创 2024-12-27 17:17:59 · 3061 阅读 · 0 评论 -
PTM翻译后修饰预测工具
蛋白质组的PTM翻译后修饰参考原创 2025-02-23 19:24:46 · 6481 阅读 · 0 评论 -
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用vscode写latex-2
vscode上写latex,解决引用来源问题原创 2025-01-15 17:11:06 · 399 阅读 · 0 评论 -
用vscode写latex-1
在vscode上写latex原创 2025-01-12 20:19:23 · 1314 阅读 · 0 评论 -
生信软件管家——conda vs pip
使用 conda 安装包之前,需要用search命令搜索 conda 包,找到安装对应包的命令后再进行安装,如果不能在下面的链接中找到安装方法,即表明该包不能通过 conda 安装。可以看到,在创建环境时指定 python 版本,和创建完环境后安装 python 的指定版本两者导致的结果并无不同,那为什么官方推荐在创建环境时使用 python=3.9 的方式指定 python。上面几个国内镜像源没有一个是绝对稳定的,都有可能抽风,连接不上,这时可以切换为其他国内镜像源。这时可以切换为其他国内镜像源。原创 2025-01-23 21:00:25 · 1533 阅读 · 0 评论 -
SPSS系列2—简单线性回归
SPSS系类回归分析原创 2025-04-07 16:08:49 · 2327 阅读 · 0 评论 -
SPSS系统发育分析中的聚类相关part
spss,做聚类,简单系统发生分析举例原创 2025-05-07 09:24:52 · 324 阅读 · 0 评论 -
SPSS ANOVA分析test
ANOVA,主效应与交互效应原创 2025-04-23 22:52:26 · 669 阅读 · 0 评论 -
SPSS系列1—无聊的列联表卡方检验
不带脑子的SPSS原创 2025-04-06 23:29:30 · 609 阅读 · 0 评论 -
SPSS PCA+判别分析
SPSS水一水原创 2025-04-30 20:56:33 · 689 阅读 · 0 评论 -
uniprot中PTM数据的下载
PTM的之前的一篇草稿,清理清理掉原创 2025-05-18 16:43:31 · 1326 阅读 · 0 评论 -
使用AlphaFold3预测蛋白质三维结构及PyMol可视化1
alphafold3网页端使用,10次每日原创 2024-12-17 17:47:43 · 12946 阅读 · 1 评论 -
interproscan
EMBOSS,interpro,以及uniprot中都有很多类似的REST API工具原创 2025-07-15 15:39:00 · 459 阅读 · 1 评论 -
HiC数据上游处理软件—HiC-Pro安装
HiC数据上游处理软件HiC-Pro安装原创 2024-09-09 12:00:38 · 2155 阅读 · 3 评论
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