- 博客(11)
- 收藏
- 关注
转载 qRT-PCR计算器
实时荧光定量PCR技术(Real-time Quantitative PCR,qRT-PCR)是指在PCR反应体系中加入可与DNA产物特异性结合的荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最终通过相对定量或绝对定量的方法确定各个样本的本底表达量。
2023-07-18 13:24:08
1405
1
转载 水稻(Oryza sativa)如何做GO富集分析
该脚本是第一个我用R写的小程序,虽然距离发布第一次用python写的小程序用于qRT-PCR结果计算的这篇推送相差一个月(https://mp.weixin.qq.com/s/HJFE4L0lQRJrGITCfl2UJg),但是阅读量却已经突破1w+,非常的意外。另外本公众号开通也有半年时间了,关注本公众号的人数也快突破1000。自己写的小程序拿出来免费供全网参考使用,在这过程中我也收到了许许多多来自于素未相识的人的一些反馈,这些反馈又使我进一步优化了自己的小程序。我想这就是这就是开源精神。
2023-07-18 13:22:15
3791
10
原创 NCBI上测序数据的下载
在生信分析中,由于论文中提供的数据有限,很多时候需要自己下载论文中的测序数据重新进行分析,从而得到自己想要的数据。而论文中的作者往往会把测序数据上传到NCBI中。因此学会如何从NCBI下载测序数据非常重要。
2023-05-12 16:41:33
1478
原创 转录组测序(RNA-seq)的数据如何分析?
经过富集分析后,我们就可以从富集到的GO term或者Pathway中寻找关键基因,通过一个GO term和Pathway里面的基因往往小于100个,至此我们就又将上千条基因的范围缩小到了100条以内。对GO term或者Pathway里面的基因进行范围的缩小也有两个方法,一种方法是根据基因的注释或者文献来找到GO term或者Pathway里面的关键基因(2-3个),另一种方法需要有相应的表型数据,与GO term或者Pathway里面基因进行相关性分析,找出与表型高度相关的基因。
2023-04-03 16:50:45
15129
2
原创 Python 孔板(微量滴定板分析):数据结构----1
通过面向对象编程(OOP)自己创建一个96孔板的一个类,并定义了孔板的遍历,孔中数据分配和检索,通过CSV文件写入孔板的数据,以及计算平均值。
2023-01-26 16:28:25
591
原创 利用Python subprocess模块实现比对,SAM转BAM,排序,索引全部流程
利用Python subprocess模块实现比对,SAM转BAM,排序,索引全部流程
2023-01-22 09:41:06
1457
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人