
linux
文章平均质量分 52
linux
zgyu
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
PBS-2
在很多情况下,我们需要提交大量相似的任务,比如大量样本的转录组数据分析,每个样本数据的分析流程都是一致的,提交的脚本中一般只有样本名字不同,那么如果对每个样本产生产生一个shell脚本,是非常麻烦的。xargs命令的作用是读入标准输入的内容并分行,对其中每一行的内容都执行相同的命令,在这里xargs读入了前面管道中qselect命令得到的某用户的所有作业编号,对于每个编号执行了qdel命令,起到了删除该用户名下所有作业的效果。我们可以通过-I选项提交一个交互式的作业,效果类似直接ssh登录到计算节点。原创 2022-10-21 15:02:57 · 812 阅读 · 1 评论 -
PBS命令
比如物理系运行程序时一般输入的命令是 RunDMol3.sh TiFeCp2-pbe-dspp-m=1-opt ,那么配置文件可以。解释:也就是说把原来在终端直接输入的命令RunDMol3.sh TiFeCp2-pbe-dspp-m=1-opt 放到pbs 配置。为b:作业开始运行发信;命令格式:qatat [-f][-a][-i] [-n][-s] [-R] [-Q][-q][-B][-u]-a date_time : date_time 格式为:[[[[CC]YY]MM]DD]hhmm[.SS]原创 2022-10-21 14:59:49 · 2652 阅读 · 0 评论 -
maker 安装
maker先在Yandell Lab进行登记,然后下载"maker-2.31.11.tgz"tar xf maker-2.31.10.tgzcd maker/srcperl Build.PL然后安装依赖包,时间较长,可能会出错./Build installdeps./Build installexes./Build install./Build status...原创 2021-11-30 11:24:01 · 1583 阅读 · 0 评论 -
培训-linux 基础命令
重要命令vi部分三种模式 打开vi的两种方法vi与vim常用参数和快捷键Home,End,PageDown,PageUpG,nG,gg/word,?word,n,Ndd,ndd,yy,nyy,p,Pu,iw,w!,q,q!,wq,ZZsetnu,setnonu,setlist,setnolist%s///g,s///g~/.vimrc,~/.viminfo基础命令基础系统date,cal,bc...原创 2021-10-29 14:41:13 · 99 阅读 · 0 评论