weixin_46814750的博客

在基因组、代谢组、蛋白质组等多组学研究中，分组条形图能够清晰地展现不同类别数据的对比。然而，许多人以为只有专业软件（Origin等）才能实现高质量的可视化。事实上，使用 R 语言及 ggplot2，我们可以在 2 分钟内复现NCS期刊级的分组条形图，并添加详细的数值与百分比标签，使图表更具专业性。本文将基于ggplot2，结合数据预处理、颜色映射、标签优化、主题美化，一步步实现高质量的分组条形图，可直接应用于科研绘图需求。大家可以参考这个代码，一起交流学习！

上周我们介绍了中国科学院城市环境研究所黄乾生研究院团队最新发表在 Microbiome上一篇文章“Disruption and adaptation: infant gut microbiota’s dynamic response to SARS-CoV-2 infection”.很多同学老师阅读后非常感兴趣文章中Fig.3 c高级图环形系统发育树的绘制，小编也想着尝试尝试，就用R进行复现。复现过程中文章一作提供了原始数据，感兴趣的同学多多关注，多多学习原文。

世界地图怎么绘制？师兄手把手带你绘制，基于R包ggplot+rnaturalearth！rnaturalearth 包提供了一个简单、可重复的工作流程，用于访问和下载 Natural Earth 的矢量和栅格数据，支持按国家和地区进行数据子集操作。它使得用户能够轻松地在 R 中获取全球地图数据，进行地理分析和可视化。

北京大学白洋老师团队最新发表在Cell上一篇文章“Crop root bacterial and viral genomes reveal unexplored species and microbiome patterns”采用了好几张高级优美系统发育树图，我阅读后一时技痒，就尝试复现一下。“这篇文章提供了完整的分析代码和绘图代码”，感兴趣的可以学习！！

怎么绘制？师兄手把手带你绘制，包含详细的数据整理！是一种 条形图（Bar Plot） 变体，通常用于可视化数据随变量变化的趋势。在生物信息学中，瀑布图主要用于突变数据分析，特别是在（Cancer Genomics） 研究中。

是生物信息学中常用的可视化工具，广泛应用于基因表达和差异表达分析。它通过。这种图形帮助研究人员快速识别在实验组与对照组之间有显著差异且变化较大的基因或特征。在生物学研究中，火山图常用于筛选等方面。包是R语言中的一个工具，基于库，简便地绘制火山图。它提供了多种自定义选项，如设置阈值、添加参考线和调整点的样式等，使用户能够根据具体数据需求优化图表，便于更好地展示差异表达分析的结果。