30.蛋白受体水模型和力场选择

以下为AI生成的大纲笔记的内容

一、蛋白受体水模型和力场选择

1.文件拖入🌟🌟

• 文件准备：使用pdb QT文件，包括蛋白和小分子配体文件、蛋白受体文件。
• 文件替换：将上述文件复制到第30步并直接替换。
• 软件操作：使用pymoll打开文件，通过拖放方式导入文件。
• 文件导出：在pymol中导出蛋白受体文件，选择蛋白基因受体并保存为pdb格式。
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• 配体文件导出：导出化合物配体文件(protein.pre.pdb)，保存为配体点pdb格式。
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• 后续处理：使用spd bv软件4.1.0处理生成的文件
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• • 导入预处理后的蛋白PDB文件（Protein.pre.pdb）
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        理后的蛋白PDB文件（Protein.pdb）

2.打开SPDBV软件🌟



• 软件启动：双击EXE文件执行程序
• 界面操作：关闭介绍窗口后返回主界面
• 文件