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课 程 简 介
第一节课--TMT、iTraq、Label-free以及DIA这几种定量技术的定量原理以及他们之间的优劣区别。
第二节课--0基础的蛋白基本分析,包括对定量表的标准化,以及用R语言对蛋白的定量结果进行不同形式的图像化展示。
第三节课--生信分析中适用于多种组学数据的差异分析方法,夯实R语言基础,0基础学会差异分析以及相关结果画图。
第四节课--生信分析中适用于蛋白及多种组学数据的GO/KEGG功能注释及画图。KOBAS网页版,以及R包两种注释方式0基础教程。
第五节课--蛋白互作网络图(PPI)的绘制,先介绍蛋白ID与各常见ID之间的转化,将指导大家用R语言以及网页版的公开数据库两种方法。再介绍string-db数据库的在线以及使用Stringdb的R包进行本地分析两种方法来展开PPI分析。最后关于蛋白节点之间的表现方式,也将介绍R语言出图以及用cytoscape进行进阶版绘图的方法。
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