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原创 R语言编程结构--R语言编程艺术学习
可以使用vim,Emacs,甚至Notepad或txt编辑器等编写R脚本,之后使用source()即可读入R中。function是R中内置的函数,功能就是创建函数, x是参数列表,如下例子。R中一个函数不仅包括参数和函数体,还包括环境(envrionment)x & y 向量的逻辑“与”运算(x, y以及运算结果均是向量)x | y 向量的逻辑“或”运算(x, y以及运算结果均是向量)x && y 标量的逻辑“与”运算。x || y 标量的逻辑“或”运算。x == y 判断是否相等。
2023-12-14 23:22:25
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原创 线性混合效应模型原理及应用
详细介绍了广义线性混合效应模型 (Generalized linear mixed- effects model(GLMMs)),它是所有线性模型的通用表达形式,可以分为广义线性模型,线性混合效应模型,一般线性模型,其中一般线性模型是广义线性模型和线性混合效应模型的特例,它们三者又是广义线性混合效应模型的特例,理论上,广义线性混合效应模型可以解决所有线性模型的问题。
2023-11-30 01:14:57
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原创 R语言实战学习--回归
文章目录普通最小二乘回归(OLS)简单线性回归多项式回归多元线性回归回归诊断标准方法QQ图正态性检验残差图误差的独立性成分残差图(偏残差图) 线性同方差性线性模型假设综合验证异常观测值高杠杆值强影响点变量添加图气泡图选择最佳模型逐步回归全子集回归k重交叉验证相对重要性普通最小二乘回归(OLS)OLS回归是通过预测变量的加权和来预测量化的因变量简单线性回归fit <- lm(weight~height,data = women)summary(fit) ## 模型拟合结果fitted
2022-05-19 00:13:10
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原创 t检验(独立样本t检验 配对样本t检验 非参检验 多余两组的比较 方差分析 非参检验)
独立样本t检验配对样本t检验非参检验多余两组的比较方差分析非参检验
2022-05-18 19:47:56
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原创 相关性检验(二维列联表相关 协方差 Pearson相关 Spearman相关 相关性检验 相关可视化)
二维列联表相关协方差Pearson相关Spearman相关相关性检验相关可视化
2022-05-18 17:50:22
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原创 列联表与独立性检验(一维列联表 二维列联表 三维列联表 ; 卡方检验 Fisher精确检验 Cochran-Mantel-Haenszel检验)
列联表一维列联表二维列联表三维列联表独立性检验卡方检验Fisher精确检验Cochran-Mantel-Haenszel检验
2022-05-18 16:50:21
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原创 ggplot作图(条形图 误差线点图 折线图 箱线图 密度图 岭图 小提琴图 云雨图 直方图 PCA图 PcoA图 NDMS图 和弦图 维恩图 时间序列图 系统发育树 饼图 生物区系图 地图 )
基本原理Plot = data + mapping +geometry + (Statistics, Scale, Coordinate) + Details基础代码常用图条形图点图误差线点图折线图箱线图分组配对点图密度图岭图小提琴图云雨图直方图PCA图PcoA图NDMS图和弦图维恩图时间序列图系统发育树饼图生物区系图地图3D图三元图相关性矩阵图组合图
2022-05-17 22:07:37
2025
原创 数据清洗--合并、添加、删除、筛选 、去重复..--tidyverse(%>%管道符号)包的应用
管道符号长宽数据转化filter 筛选slice选取行distinctselect选择列arrange排序mutate添加新列rename 更改变量名join合并
2022-05-08 14:43:27
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原创 R语言中常用的生物多样性指数的计算(Alpha,Beta,Gamma,功能多样性,系统发育多样性)
library(vegan) ##加载群落数据分析常用的包data(BCI) ##vegan包中自带的群落数据shannon <- diversity(BCI,MARGIN = 1) ## Shannon 多样性指数, MARGIN=1 计算行的多样性 ,一般的群落数据表行名为样方名,列名为物种名 index默认为“shannon”simpson <- diversity(BCI,index = “simpson”,MARGIN = 1) ## Simpson多样性指数SR
2022-04-14 14:08:15
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原创 远程操控计算机,将手机平板与电脑连接起来--随时办公
向日葵_360搜索在日常生活中,有的时候可能计算机不在身边,朋友们也想随时办公,在这里推荐一款软件“向日葵”,可以用手机等移动设备控制电脑的桌面,干平时在电脑上可以完成的工作,非常方便。软件如下:向日葵远程控制界面:将远程控制的设备的识别码和密码输入即可远程控制了,也可以远程传输文件控制后的界面如下:...
2022-04-12 21:40:27
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原创 Rstudio与R的绑定和更新
遇到新安装的R与Rstudio没有匹配或者想要更改R的版本(一些老的版本的安装包在新版R上可能不适用)可以如下操作一、Rstudio与R的绑定1 选择Tools里的Global Options选项2 选择General更改R version3 更改你想更改的版本二、Rstudio与R的更新1 Rstudio中R的更新代码install.packages("installr")library(installr)updateR()2 Rstudio...
2022-04-12 16:34:11
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空空如也
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