水木的编程生涯

你想拥有自己的R包吗？

目录一、PWM与PFM的介绍二、根据碱基序列手工制作PFM与PPM1. 主要实现函数2. 实现效果2.1 制作DNA的motif logo2.2 制作RNA的motif logo三、PFM-\>PPM-\>PWM四、待优化一、PWM与PFM的介绍motif指的是转录因子偏好结合的DNA序列模式或RNA结合蛋白偏好结合的序列模式，一般使用PWM来表示motif。制作PWM的过程如下：首先计算所有序列每个位置的碱基频数，可以得到PFM(Position FrequencyMatrix)，

目录前面的啰嗦绘图数据说明基本箱线图分组箱线图美化分组箱线图箱线图完整版代码基本箱线图的完整代码分组箱线图的完整代码前面的啰嗦本教程对绘图所需数据和绘图过程进行了一步步的解释，稍显啰嗦，没时间细看或不想一步步看的朋友可以直接点击目录最后一节:箱线图完整版代码绘图数据说明用到的数据是mpg数据集，这是ggplot2包自带的数据集，可以使用以下代码查看该数据集的基本情况：library(ggplot2)?mpg # 或者help(mpg)从帮助文档中可以看出这是一个234x11的数据框，它记录

目录前言习题Problem 2习题描述习题里的图我画的图我的绘图代码前言偶然看到了这个链接里有几张图可以用来练习ggplot2，就试着写了一下代码，这里记录一些我认为有些难度的图与代码。习题Problem 2习题描述Using the mpg dataset in the ggplot2 package, replicate the plot below using the following settings:Set alpha = 0.5 for the width of barsUse

前言在R里面安装R包时总会遇到这样那样的报错，非常烦人，为了避免以后少踩坑，我决定在遇到报错后及时将报错信息与解决办法记录下来，积少成多，希望自己解决bug的能力越来越强，也希望能让大家少走弯路。报错1：Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD else character() : argument is of length zero报错信息解读：Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD els

一、数据处理相关R for Data Science（《R数据科学》）电子版R for Data Science: Exercise Solutions数据科学中的R语言：这是四川师范大学研究生公选课《数据科学中的R语言》的课程内容。可以考虑和《R for Data Science》交互使用。二、画图相关数据可视化基本套路总结1 ggplot2教程建议在学习ggplot2的时候将下面的链接全部打开，想画哪种图就去里面找。ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)ggplo