FASTA 与 FASTQ格式详解

FASTA

1.FASTA存储什么？

fasta存储核酸序列（DNA/RNA），也存储蛋白质的核苷酸序列（Animo Acid sequence，简称AA序列）

2.FASTA包含什么内容？

第一行：以“>”开头主要存储的是序列的描述信息

第二行：序列

3.例子1： AA序列（核苷酸序列）

UniRef数据库中下载的人类血红蛋白α亚基的序列。

>sp|P69905|HBA_HUMAN Hemoglobin subunit alpha OS=Homo sapiens GN=HBA1 
MVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHG
KKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTP
AVHASLDKFLASVSTVLTSKYR

从第一行看起：

第二行开始：核苷酸序列的信息，我们一般使用下面的对应表。