【Lammps】atomsk安装与环境变量设置（Linux环境）

官网

https://atomsk.univ-lille.fr/dl.php

下载的安装包如下：

使用Linux的解压命令进行解压：

tar -xzvf file.tar.gz

注意：file.tar.gz 替换为自己下载的安装包名称。

解压后有如下文件：

我们看到有examples文件夹，里面有很多atomsk自带的例子，我们直接进去运行看看，能不能成功？

用 bash XX.sh 或source XX.sh

以Al_dislocation.sh为例运行，

首次运行报错，显示报错：

-bash: atomsk: command not found

这是由于环境变量没有设置，所有atomsk命令没有生效，接下来添加atomsk到当前用户的环境变量。

配置环境变量

1. 找到当前的 atomask 所在文件的路径

先cd到我们最开始安装的位置，然后使用pwd命令即可。

比如我的atomsk的路径为：

/data/home/hw23/atomsk_b0.13.1_Linux-amd64

2. 找到atomsk的路径后，前往用户的根目录（可以使用命令 cd /）

3. 编辑 bashrc

输入 vi .bashrc，然后回车，出现如下内容，在箭头下面加入如下内容：

export PATH=“$PATH:/home/zma/software/atomsk_b0.11.2_Linux-amd64”

export PATH="$PATH:/data/home/hw23/atomsk_b0.13.1_Linux-amd64" 

这个路径根据 atomsk文件 所在安装路径而定。

3. 输入source .bashrc，然后回车。使刚才的环境变量生效。直接输入atomsk也可以进入atomsk软件了。

可以用echo $PATH命令查看，atomsk所在路径已经添加进来了。

测试

测试：回到刚才Al_supercell.sh所在路径，再执行source Al_supercell.sh命令

运行成功！结果如下图：

参考博客：

https://www.bilibili.com/read/cv16793408/