
Fiji/Image/Imaris
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煦煦向前
生医硕士,快乐学习,快乐生活~
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Imaris 的Surface工具Contour, masking, artificial dissection
内容来源Imaris bilibili官方教程实际上看一遍记不住,需要用的时候再来看Imaris能不能实现,如果能,再去看视频文章目录区分信号与背景Masking 功能实现下图效果【视频27:20】删除channel的方法Contour功能实现只展示某个部分的surface还能与其他的一起展示区分信号与背景Step1: 创建一个surface.如果有感兴趣区域可以勾选Step2:点击上个图的右下角蓝色小按钮,进入第二步。先选择要查看的通道。然后可以使用Surface Detail值筛选大原创 2022-05-31 10:56:29 · 2587 阅读 · 0 评论 -
Imaris 不同通道\切面\模式作图展示
以下内容为 Imaris哔哩哔哩官方账号教学视频的学习笔记。节约内存,仅供学习。本视频可以实现的效果图包括示例1示例2:示例3:示例4:Ortho Slicer展示一个层面Slice Position可以调整图的位置;Slice Orientation可以调整图的方向Extended Section调节厚度,可以显示某个区段的信号(注意要取消勾选Volume可以只显示这个区段的信号)对不同部分赋予不同的伪彩【视频8:00】以达到下面这样的效果要先使用 Surface原创 2022-05-30 22:25:16 · 5564 阅读 · 0 评论 -
Imaris导入数据和初步使用
以下内容为Importing data into Imaris and the basics of image visualization._哔哩哔哩_bilibili的学习笔记,仅记录方便查看。节约存储空间所以写在这里哈哈哈视频功能目录转化为Imaris格式旋转 和 拖动显示不同通道对比度展示模式标尺设定是否显示导入tif序列图像为3DSlice 模式下,可以进行一些测量提取channel [视频27:00分]对于Imaris无法识别的格式,可以借助FIJISection模式下查看裁剪下采样调整标尺的原创 2022-05-30 20:30:28 · 12446 阅读 · 5 评论 -
Fiji/ImageJ调整图像的对比度;Fiji/Image查看图像的像素直方图分布
很多ImageJ/Fiji的问题用中文查不到,尽早尝试用英文去搜索!!!!!!!!下面记录两个小功能,以及英文教程和imageJ写脚本的教程。调整图像对比度Step1:打开一张图像。比如我的一个tif图特别暗,就可以调一调对比度Step2:调整对比度使用快捷键:Ctrl+Shift+C或者:Image—>Adjust —>Brightness/Contrast得到下面这个调节框,然后一般点击Auto就可以了,也可手调查看图像的像素直方图分布Step1:打开一张图像原创 2022-05-29 22:25:29 · 10642 阅读 · 0 评论