DeepSurvk部署教程

本文是DeepSurvK的部署教程,详细介绍了如何在Python3.7环境中,利用PyCharm创建虚拟环境并安装deepsurvk包。作者指出了安装过程中可能遇到的版本不兼容和DLL缺失问题,提供了安装CUDA和解决缺失dll的方法。最后,展示了代码测试过程和模型训练的步骤。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

DeepSurvk部署教程

作者:千树、Totoro

一、DeepSurvk简介

  • 项目作者原话(翻译)

    DeepSurv 是一种 Cox 比例风险深度神经网络,用于模拟患者协变量与治疗效果之间的相互作用。它最初是由Katzman等人提出的。al(2018)并在Theano中实现(使用Lasagne)。

    不幸的是,不再支持Theano。已经有一些尝试在其他DL平台上重新创建DeepSurv,例如czifan的DeepSurv.pytorch。然而,鉴于它的受欢迎程度和易用性,我认为TensorFlow 2的Keras是完成这项任务的一个很好的选择。

    Mexchy1000 创建DeepSurv_Keras。然而,它是一个非常原始的原型:它没有被适当的记录或验证。此外,它不再得到积极支持。因此,我将其作为开发DeepSurvK的粗略起点。

    这是我的第一个 Python 包。我相信有很多地方可以改进。随时欢迎反馈!

  • 前言

    写这篇文章的目的是为了记录安装deepsurvk中遇到的种种问题和解决方法,也为将要使用deepsurvk的同学们提供参考。deepsurvk安装过程中,由于库比较多,容易出现版本不兼容问题,一旦装错,就得重新再来。朋友要使用deepsurvk做实验,我在帮她安装deepsurvk的过程中遇到了很多问题,后面花了两天时间才解决。于是就打算写一篇博客记录下来帮助后来者减少时间浪费,也总结在安装过程中遇到的经验教训。

二、安装环境

三、新建项目

  • 1.新建虚拟环境项目

    建虚拟目录的好处是可以和原先的目录隔离,避免包的版本冲突

    在这里插入图片描述

  • 2.在pycharm的终端(terminal)运行命令 pip install deepsurvk

    要在pycharm的终端中运行命令,cmd中运行命令会安装到默认的库,模拟环境有自己的库

    在这里插入图片描述

  • 3.使用 pip show deepsurvk 查看是否安装成功

    在这里插入图片描述

  • 4.由于包比较多,安装会比较费事,不想用命令行安装的同学可以直接下载,放在 E:\ProgramDevelopmentProject\pycharmProject\pythonProject1\deep_survk_project\Lib\site-packages 目录下面

    链接:https://share.weiyun.com/0S28yDMZ 密码:kww9ue

    复制过程中,重复的文件可以直接跳过

四、代码测试

  • 测试代码

    import os
    import pandas as pd
    import deepsurvk
    import t
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