python文件追踪（可用于ADNI数据集将多个文件夹下的nii改名后保存）

最新推荐文章于 2023-11-10 15:39:04 发布

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#文件追踪 #批量文件重命名 #文件另存为

这篇博客主要介绍如何处理ADNI数据集中分散在多个文件夹下的nii文件。通过运用os.walk()函数，遍历所有文件夹和子文件夹，将nii文件批量重命名为简洁格式，如'002_S_0559'，并将它们保存到同一目录以便进一步处理，例如进行nii到png的转换。

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写这篇文件追踪的原因主要是：

下载了ADNI数据集后，nii文件是在5个文件夹下，不能直接用nii转png的代码（代码见下面链接），所以需要先将nii文件保存到同一个文件夹下。

批量nii转png：https://blog.youkuaiyun.com/weixin_43330946/article/details/89576759

同时要将nii文件改名（下载下来的nii文件名字比较长）：比如都改成002_S_0559的格式。

这里会用到os.walk()函数，可以遍历文件夹、子文件夹、文件。

import os
import nibabel as nib

rootdir = 'nii主文件夹路径（即最后一个总文件夹）'
rootdir1 = '重命名后保存的路径'
list = os.listdir(rootdir)

for parent, dirnames, filenames in os.walk(rootdir):
    for dirname in dirnames:
        #print('1')
        path = os.path.join(rootdir, dirname)
        for parent1, dirnames1, filenames1 in os.walk(path):
            #print('2')
            for dirname1 in dirnames1:
                path1 = os.path.join(path, dirname1)
                #print('3')
                for parent2, dirnames2, filenames2 in os.walk(path1):
                    for dirname2 in dirnames2