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这个作者很懒，什么都没留下…
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【PaperReading】HiPub: translating PubMed and PMC texts to networks for knowledge discovery
这篇文章介绍了一个知识提取插件：HiPub，使用时下载其扩展程序放到你的Chrome中就可以使用了HiPub：将PubMed和PMC文档转换成网络以提取知识摘要我们介绍了HiPub，一个无缝的Chrome浏览器插件，能够从文本中自动识别、注释以及转换生物实体为网络以提取知识。使用两个不同命名实体识别资源的别和，HiPub能够识别文本中的基因、蛋白质、疾病、药物、突变体以及细胞系，并且达到了很...原创 2019-01-02 19:56:00 · 1019 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】fusionDB:assessing microbial diversity and environmental
《fusionDB：assessing microbial diversity and environmental preferences via functional similarity networks》《fusionDB：通过功能相似网络评估微生物多样性和环境偏好》摘要微生物功能多样化是由环境因素驱动的，即生活在同一环境生态位的微生物往往比生活在不同环境中的微生物在功能上更相似。在某...原创 2019-06-21 15:49:53 · 271 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】CancerMine: a literature-mined resource for drivers, oncogenes and tumor suppressors i
《CancerMine: a literature-mined resource for drivers, oncogenes and tumor suppressors in cancer》癌症基因:为癌症的驱动因素、致癌基因和肿瘤抑制因子而开发的文献资源来自癌症患者的肿瘤经常被遗传分析，以了解疾病背后的驱动力。我们提出了癌症资源，一个文本挖掘和定期更新的数据库驱动器，致癌基因和肿瘤抑制在不...原创 2019-05-29 21:57:39 · 506 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】Completeness and accuracy of drug information in Wikipedia articles
Text2Onto A Framework for Ontology Learning and Data-driven Change Discovery《Text2Onto——本体学习和数据驱动的变更发现框架》摘要 在本文中，我们介绍Text2Onto，一个从文本资源中进行本体学习的框架。三个主要特征区别于我们早期的框架TextToOnto以及其他最先进的本体学习框架。首先，通过在所谓的概率本...原创 2019-04-30 20:27:44 · 153 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】Eliciting Disease Data from Wikipedia Articles
《Eliciting Disease Data from Wikipedia Articles》从Wikipedia文章中获取疾病数据摘要传统的疾病监测系统存在一些缺点，包括报告滞后和过时的技术，这些缺点导致了基于互联网的疾病监测系统的发展。互联网系统对于疾病爆发尤其具有吸引力，因为它们可以近乎实时地提供数据，并且可以由全球各地的人员进行验证。但是，大多数现有系统都侧重于疾病监测，并没有为决...原创 2019-05-05 10:48:17 · 196 阅读 · 2 评论 -
【PaperReading】Analysis of reference sources used in drug-related Wikipedia articles
《Analysis of reference sources used in drug-related Wikipedia articles》分析与药品有关的维基百科文章中使用的参考来源介绍维基百科是一个开放获取的在线百科全书，由用户[1]共同编写和编辑。维基百科包含各种主题的信息，包括与健康相关的主题。药剂师、药学专业学生和其他药物信息搜索者在进行在线搜索时可能会遇到Wikipedia页面...原创 2019-05-03 20:40:19 · 188 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】Global Disease Monitoring and Forecasting with Wikipedia
《Global Disease Monitoring and Forecasting with Wikipedia》使用Wikipedia进行全球疾病监测和预测摘要传染病是对公共卫生、经济稳定和其他关键社会结构的主要威胁。减轻这些影响的努力依赖于准确和及时的监测，以衡量疾病的风险和进展。传统的、以生物为重点的监测技术是准确的，但成本高、速度慢;作为回应，基于社交网络数据的新技术，如社交媒体和...原创 2019-05-03 19:41:49 · 239 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】Linked open data-based framework for automatic biomedical ontology generation
《Linked open data-based framework for automatic biomedical ontology generation》《链接开放的基于数据的框架，用于自动生成生物医学本体》摘要背景： 实现语义Web的愿景需要一个准确的数据模型来组织知识和分享对专业领域的通用理解。据此，本体是语义Web的基石，可以用于解决临床信息和生物医学工程的许多问题，例如词义消歧，...原创 2019-04-12 15:42:50 · 916 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】IMP 2.0: a multi-species functional genomics portal for integration, visualization and
IMP 2.0: a multi-species functional genomics portalfor integration, visualization and prediction of proteinfunctions and networks《IMP2.0：一个多物种功能基因组学门户，用于蛋白质功能与网络的整合、可视化及预测》摘要IMP（多物种综合预测），最初在2012年...原创 2019-03-11 15:00:56 · 267 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】Construction of Semantic-based Traditional Chinese Medicine Prescription Knowledge Gra
《Construction of Semantic-based Traditional Chinese Medicine Prescription Knowledge Graph》《基于语义的中药处方知识图谱构建》摘要在大数据时代，知识图谱是知识管理和应用的重要数据资源。知识图谱是已经成为各个领域的搜索引擎的语义检索、知识推理和决策等关键技术的基础。本文首先通过整合疾病，症状和处方的各种数据...原创 2019-03-14 21:13:51 · 649 阅读 · 0 评论 -
【PaperReading】PHI-base: a new interface and further additions for themulti-species pathogen–host int
《PHI-base: a new interface and further additions for themulti-species pathogen–host interactions database》《PHI-base：一个新的接口和进一步增加的多物种病原体-宿主相互作用数据库》摘要病原体-宿主相互作用数据库(PHI-base)可在www.phi-base.org上获得。phi_...原创 2019-06-23 14:41:23 · 850 阅读 · 0 评论