imagej链接资源

宏

宏是一个自动执行一系列ImageJ命令的简单程序。创建宏的最简单的方法是录制一系列的命令：Plugins-Macros-Record。
宏存成一个.txt或.ijm后缀的文本文件，然后通过Plugins-Macros加载。
关于宏编程的教程有：

• The ImageJ Macro Language
• The Built-in Macro Functions webpage
• Tutorials on the Fiji webpage
• How-tos and tutorials on the ImageJ Documentation Portal

脚本

原生ImageJ脚本是用JavaScript语言写成。
资源有：

• The ImageJ web site, with growing documentation
• Tutorials on the Fiji webpage
• Online scripts repository

Fiji则支持其他语言，比如BeanShell、Clojure、Python和Ruby。
资源有：

• Jython Scripting
• Jython Scripting Examples
• The extensive tutorial on scripting Fiji with Jython by Albert Cardona
• Dedicated tutorials on the Fiji webpage

插件

插件是用Java写成。
资源有：

• Developer Resources Page on the ImageJ website
• Dedicated tutorials on Fiji’s webpage
• Dedicated tutorials on the ImageJ Documentation Portal
• Dedicated tutorials on the ImageJDev webpage

命令行运行ImageJ

可以在命令行运行ImageJ，教程有：

• Running ImageJ in headless mode
• Using Cluster for Image Processing with IJ