利用openslide 、open CV 全扫描图片处理笔记(二)

在cv2中调节窗口大小

openCv里显示图片大小,默认是自动调整,但是如果图片尺寸太大 那么不能完全显示

#创建窗口,这句也可以不写,直接imshow是自动调整显示窗口大小,人工不能调;值为2时,可以鼠标调整
cv2.namedWindow("窗口名", 1) 
cv2.imshow("窗口名",要显示的图片) # 在创建的窗口中显示图片
cv2.namedWindow("待拼接图像1",0) #创建窗口
cv2.resizeWindow("待拼接图像1", 800, 800) #创建一个固定值大小的窗口
imshow("待拼接图像1",image01)

参考:https://blog.youkuaiyun.com/JohinieLi/article/details/78087579


在原图上寻找轮廓

在原图上画出mask区域

参考博客:地区位置

如何利用mask对原图进行抠图

主要问题为:如何利用mask对原图ROI区域 抠图或者不抠图(将ROI区域分个成240*240像素的小图),而将ROI区域外也分割成若该240*240像素小图但是分开保存。

wsi图像的预处理

需要去背景,使用基于阈值的分割自动检测背景区域,去除背景,减少计算时间。

将图像从RGB色彩空间转变到HSV,使用Otsu计算每个通道的最佳阈值,之后根据H和S通道掩码得到最终掩码图像。每张图像背景占比82%左右。

RGB_TO_HSV参考链接
大津算法Otsu’s thresholding 参考链接

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