Slurm作业调度系统中的bash循环

笔者在slurm批处理脚本中需要用到循环,依次处理每个.dat文件,最开始用的是while循环

#!/bin/bash

#SBATCH -p xxx
#SBATCH -o xxx
#SBATCH -e xxx
#SBATCH -n xxx

ls *.dat >flist
cat flist | while read fname
do
mpirun [MPIOPT] mycommand 
echo $fname
done
exit

但是提交任务之后,始终只执行一次即跳出循环,如果注释掉mpirun,则能够进行循环。我百思不得其解。

于是果断改成了for循环

#!/bin/bash

#SBATCH -p xxx
#SBATCH -o xxx
#SBATCH -e xxx
#SBATCH -n xxx

ls *.dat >flist
for fname in $(cat flist)
do
mpirun [MPIOPT] mycommand 
echo $fname
done
exit

成功!

当然,while循环为什么不行还需要高人指教。

评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值