
rDock系列
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分子对接rDock的案例介绍
Blockbuster_drug
实践、分享、传播
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开源分子对接程序rDock使用方法(2)-高通量虚拟筛选HTVS
rDock是一个快速、多功能的开源对接程序,可用于将小分子配体与蛋白质或核酸受体的对接;选用不同的对接模式可以完成考虑受体结合水的分子对接(Docking with explicit waters)以及药效团限制性对接(Docking with pharmacophore restraints),也可以用来做高通量虚拟筛选(HTVS)。本文介绍 rDock采用Multi-Step Protocol进行高通量虚拟筛选HTVS的流程及使用案例。原创 2024-03-13 19:50:02 · 1552 阅读 · 2 评论 -
开源分子对接程序rDock使用方法(1)-Docking in 3 steps
rDock是一个快速、多功能的开源对接程序,可用于将小分子配体与蛋白质或核酸受体的对接;选用不同的对接模式可以完成考虑受体结合水的分子对接(Docking with explicit waters)以及药效团限制性对接(Docking with pharmacophore restraints),也可以用来做高通量虚拟筛选(HTVS)。本文介绍 rDock用于受体-配体的标准对接(Docking in 3 steps),为研究其他模式下的分子对接打好基础。原创 2024-03-08 07:00:00 · 2106 阅读 · 2 评论 -
开源分子对接程序rDock的安装及使用流程
本文介绍了rDock的两种安装方式及使用流程,为开始使用rDock的朋友提供参考以及快速入门指导。后续系列文章将结合案例详细介绍rDock使用。原创 2024-02-22 18:00:00 · 3485 阅读 · 1 评论