little^raccoon

部分转载自陈连福的生信博客当我运行得到结果文件后，需要删除当前目录下许多的中间文件夹：find ./ -maxdepth 1 -type d -regex "./\w.*" -exec rm -rf {} +各参数意义如下：,./ 是被搜索的文件夹-maxdepth 1 表示仅搜索第一层目录-type d 表示仅搜索文件夹类型数据，该参数要放-maxdepth参数后面，否则程序会有警告信息。-regex “./\w.*” 使用正则表达式方式搜索数据，该正则表达式不会搜索当前目录下名称.

perldoc perllocal #查看已安装的模块

grep 同时满足多个关键字和满足任意关键字grep -E "word1|word2|word3" file.txt满足任意条件（word1、word2和word3之一）将匹配grep word1 file.txt | grep word2 |grep word3必须同时满足三个条件（word1、word2和word3）才匹配...

yum -y install dos2unix#

awkawk '{print ">"$9"\n"$10}' file.gff3Pythonfr = open('./file.gff3', 'r')for line in fr.readlines(): name = '>' + line.strip().split('\t')[8] seq = line.strip().split('\t')[9] ...

指定多种分隔符awk -F '[\t;]' '{print $0}' #指定\t和;为换行符

awk '!a[$1" "$2]++{print}' text.txt原理”!” 非a[$0]，以$0为数据下标，建立数组aa[$0]++，即给数组a赋值，a[$0]+=1