weixin_40081460的博客

本文仅做logistic回归分析构建的列线图部分，其余部分已经很简单，包括DCA曲线 ROC曲线 相关性棒棒糖图，已经有不少教程，而且箱式图等也不难。因此不再进一步做了。

上文复现了DEG和WGCNA之后，与原文章有出入，最后我借用sangerbox工具取交集，选出210个gene进行LASSO和SVM分析，继续筛选核心基因，其实可以使用更多的机器学习办法，如随机森林和Xgboost。LASSO回归结果和原文差别不小，我注意到原文四个基因都在那210个基因中，但是LASSO只选出了6个，其中只有2个基因和原文一致，LASSO具体参数尚不清楚。取前38个基因和LASSO取交集，只有SOCS2和FOSB和原文一致，SVM估计参数也不一样，恳请指正。

文章学习，并尽量复现文章。