weixin_38605247的博客

基本概念与分析原理的理解做生物信息以来一直对排序等的概念不是特别理解。这两天查了几篇资料，梳理了一下，做一下简要的总结。 1.排序： 假设我们有一个OTU表： 行为样本，列为OTU（也可以理解为特征）。我们要对这4个样本进行排序： 假如只有一个otu: 那么根据这一个OTU在每个样本中的值就可以排序啦。 假如有两个OTU（otu_9,otu72）：我们

在R中，paste() 函数主要是用于字符串连接。 paste()函数的使用非常简单，下面简单举例：for (i in 1:5){ string<-paste("abc",i,"de",sep="") print(string)}for (i in 1:5){ string<-paste("abc",i,"de") print(string)}输出: 注意，sep=”“，还

使用R，ggplot2绘制NMDS图输入文件准备mapping.txt ：样品名与分组信息 otu.txt : otu表 文件下载 : https://github.com/tangshanshaolu/R_test.git代码部分library(vegan)library(ggplot2)pdf("nmds.pdf")otu<-read.table("otu.txt",heade