一些R函数【自己使用过,保存】

本文介绍了一系列使用R语言进行数据可视化的方法,包括如何使用plotrix包添加断轴、利用beeswarm包绘制蜜蜂群图并结合盒形图展示数据分布;同时介绍了如何通过ade4包计算矩阵之间的相似性、ape包进行主坐标分析(PCoA),以及高效计算Kendall相关系数的函数。此外还提供了用于检验两个分布相似性的ks.test()函数和卡方检验的chisq.test()函数。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

1. library(plotrix)  axis.break()  为图形添加断轴

2. library(beeswarm)  beeswarm  蜜蜂群图

http://rgm3.lab.nig.ac.jp/RGM/r_function?p=beeswarm&f=beeswarm

可以结合盒形图展示。

 3.求两个矩阵相似性

  library(ade4)

  coinertia() 函数

4.PCoA

  ape包 pcoa()函数 

5.高效率算Kendall相关系数:Package ‘pcaPP’ , cor.fk函数

  Calculates Kendall’s tau rank correlation coefficient in O (n log (n)) rather than O (n\^2) as in the
  current R implementation

6.检验两个分布是否相似

  ks.test()

7.卡方检验

  chisq.test()

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