Calinski-Harabasz准则有时称为方差比准则 (VRC),它可以用来确定聚类的最佳K值。Calinski Harabasz 指数定义为:
其中,K是聚类数,N是样本数,SSB是组与组之间的平方和误差,SSw是组内平方和误差。因此,如果SSw越小、SSB越大,那么聚类效果就会越好,即Calinsky criterion值越大,聚类效果越好。
1.下载permute、lattice、vegan包
install.packages(c("permute","lattice","vegan"))
2.引入permute、lattice、vegan包
library(permute)
library(lattice)
library(vegan)
3.读取数据