R语言：提取路径中的文件名字符串（basename函数）

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于 2018-02-02 20:31:00 发布

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文章标签： r语言

原文链接：http://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/8407023.html

本文介绍了一种使用R语言中的basename及substr函数从文件路径中提取特定子串的方法。通过两个例子展示了如何提取'Homo'和'exon1'等特定字符串。

假设存在路径C:/coverage/Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt，欲提取Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt文件名，则用到basename函数和start、stop参数，命令行如下所示：

filename<-'C:/coverage/Homo_sapiens.sort.add_exon1_coverage.txt' 
substr(basename(filename), start = 1, stop = 4) #表示提取文件名的第一个字符至第四个字符，即Homo
substr(basename(filename), start = 23, stop = 27)#表示提取文件名的第23个字符至第27个字符，即exon1
paste(substr(basename(path), start = 1, stop = 4),substr(basename(path), start = 23, stop = 27)) #将两个字符黏贴起来

效果如下图所示：