matlab半小提琴图,不会编程，也可以画小提琴图啦！

原标题：不会编程，也可以画小提琴图啦！

在展示多个基因的差异表达时，我们常会用到火山图、热图、曼哈顿图等进行结果的统计与可视化，非常高大上。

但对于少数几个基因的话一般用什么来展示其表达差异呢，也有多种办法，比如箱线图，柱状图等。

小提琴图是箱线图与核密度图的结合，因其形态类似小提琴而得名，可展示任意位置的基因丰度。

2016年一篇AML遗传异质性文章中用小提琴图展示启动子epiallele对基因转录表达水平的影响，发表在Nature Medicine，2017年一篇PANS文章也用小提琴图展示了1124个转录和染色质修饰因子对侵入模块表达的贡献。

之前基迪奥已经介绍过用R语言绘制小提琴图的方法，但许多小哥哥小姐姐表示R语言需要一定的编程基础，难度较大。

今天Omicshare云平台重磅推出一款高颜值的小提琴图绘制工具，可对数据进行分析、可视化，导出出版级别的图片，帮助大家冲击高分文章。下面我们就介绍一下这款工具如何操作。

登录云平台

登录Omicshare云平台(网址：www.omicshare.com/tools)，在“所有软件”中找到小提琴图。

图1.小提琴图工具位置展示

输入文件准备

点击图标进去之后，会跳转到操作界面。界面包括“数据输入”以及“作图参数”两部分。输入文件为txt格式，也可用excel另存为制表符分隔的txt格式，通过“选择文件”按钮，轻松导入数据，上传数据的格式可以通过点击“示例”查看。

图2. 数据输入界面展示

作图参数

为方便对图形进行修改，我们提供以下作图参数：其中数据散点系统是默认不显示的，大家可自行选择显示或不显示，图形名称暂不支持中文，图形默认颜色提供两种选择。自定义颜色是在调色板中选颜色，若不选择，就自动使用系统默认的骚气渐变色

，你值得拥有~

图3. 作图参数界面

输出结果

在Omicshare的云平台提交任务数秒后会输出结果压缩包，包含分析结果数据表和小提琴图两部分：

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结果数据

提供xls格式表格下载，包括中位数、下四分位数、上四分位数、最大值等这些统计数据。

图4：分析结果数据

2

小提琴图

小提琴图提供常见格式PNG及PDF版本下载。

图5: 小提琴图形展示

图形解读

为方便大家理解小提琴图，特做如下解读：

①白点代表中位数Q2(即数据中有一半大于中位数，在其之上，另一半小于中位数，在其之下)；

②黑色矩形是下四分位数到上四分位数的范围，矩形上边缘为上四分位数Q3，代表数据中有四分之一的数目大于上四分位数，下边缘为下四分位数Q1，代表数据中有四分之一的数目小于下四分位数；

四分位间距IQR(上四分位数和下四分为数间距)长短代表非异常数据的分散和对称程度，长则分散，短则集中；

③上下贯穿小提琴图的黑线代表最小非异常值min到最大非异常值max的区间，线上下端分别代表上限和下限，超出此范围为异常数据 ；

④黑色矩形外部形状为核密度估计，图形纵轴方向长度代表数据弥散程度，横轴方向长度代表在某纵坐标位置数据分布量。返回搜狐，查看更多

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