学校有管理科学与工程、计算机科学与技术2个学科进入参评学校的前10%；其中，管理科学与工程学科排名全国第2。
在教育部第四轮学科评估中，合工大管理科学与工程学科被评为A类，5个学科被评为B+，分别是计算机科学与技术、机械工程、仪器科学与技术、工商管理、马克思主义理论。
合肥工业大学共有6个学科居ESI全球排名前1%，分别是化学、工程学、材料科学、计算机科学、农业科学、地球科学。
2017年9月，合肥工业大学入选一流学科建设高校，管理科学与工程入选"双一流"建设学科。学校重点建设"工程管理与智能制造"学科，该学科是以管理科学与工程学科为核心，融合计算机科学与技术、机械工程学科而形成的新兴交叉学科，并辐射到仪器科学与技术、电气工程等优势特色学科，通过优势特色学科、先进特色学科群、基础学科群和新兴交叉学科的建设，从而带动提升学校学科建设的整体水平。
长期以来，合肥工业大学面向国家重大战略需求、经济社会主战场和世界科技发展前沿，坚持走工业报国、工业兴国、工业强国之路，在工程管理、高端装备制造等领域形成了鲜明的优势特色。未来，学校将牢记使命，为建设国际知名的研究型高水平大学和一批世界一流学科而继续奋斗！
部分素材来源：合肥工业大学官微、软科、合肥工业大学学科建设与评估办公室
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