r roc函数_R: ROCR包用于ROC分析

ROC曲线用于评估二分类响应变量的预测效果,例如比较不同预测指标(如血压值和体重)在预测高血压中的作用。ROCR包提供分析ROC数据的功能,包括prediction对象、性能计算和绘图。通过TPR和FPR计算,ROC曲线的AUC可衡量预测能力,0.5-0.9的AUC表示不同级别的预测能力。ROCR包主要涉及prediction、performance和plot三个函数,可用于计算和展示ROC曲线。

受试者工作特征曲线 (receiver operating characteristic curve,简称ROC曲线),又称为感受性曲线(sensitivity curve)。

ROC可以用于:(1)比较预测二分类响应变量的预测效果;(2)获取预测二分类响应变量的连续预测变量的阈值。

比如在预测病人有无高血压时,有无高血压为二分类的响应变量:有或无,使用测量的血压值为预测变量,血压值为连续变量。

假如还想通过体重来预测有无高血压,那么要比较这两个模型:血压值及体重究竟哪个指标能更好的预测有无高血压就是用途(1),而选择哪一个数值是比较好的界定“有无高血压”的阈值,就是用途(2)。

ROCR包与ROC

一个用于分析ROC的数据是一组连续变量和一组二分类变量,连续变量是预测变量,分类变量是响应变量。

在ROCR包中,这两组数据被称为“predictions“和”labels“。

如下所示为ROCR包的示例数据ROCR.sample。

# 载入工具包
library(tidyverse)
library(ROCR)

data(ROCR.simple)
ROCR.simple %>% as_tibble
# # A tibble: 200 x 2
# predictions labels
#   
# 1       0.613  &nb
在R语言中,ROC曲线是用于评估分类模型性能的一种常见方法。ROC曲线的横轴是“假阳性率”(false positive rate, FPR),纵轴是“真阳性率”(true positive rate, TPR),其形状反映了模型在不同阈值下的性能表现。在R语言中,可以使用`ROCR`中的`prediction()`和`performance()`函数来计算和绘制ROC曲线。 下面是一个简单的例子: 假设我们有一个二元分类问题,我们使用逻辑回归模型来进行预测。首先,我们需要用训练数据来训练模型,然后用测试数据来测试模型的性能。 ```R library(ROCR) # 训练模型 model <- glm(target ~ predictor1 + predictor2, data=train_data, family=binomial) # 预测测试数据 prob <- predict(model, newdata=test_data, type="response") # 计算ROC曲线 pred <- prediction(prob, test_data$target) perf <- performance(pred, "tpr", "fpr") # 绘制ROC曲线 plot(perf) ``` 在上面的代码中,我们首先使用`glm()`函数来训练逻辑回归模型。然后,使用`predict()`函数来预测测试数据的结果。`type="response"`表示我们想要得到的是每个测试样本属于阳性类别的概率,这个概率值可以用来计算ROC曲线。接着,我们使用`prediction()`函数将预测结果和实际标签组成一个`prediction`对象。最后,我们使用`performance()`函数计算TPR和FPR,并用`plot()`函数绘制ROC曲线。 注意,这里的`train_data`和`test_data`是我们事先准备好的训练数据和测试数据,其中`target`是二元分类的目标变量,而`predictor1`和`predictor2`是模型的特征变量。在实际应用中,我们需要根据具体问题来选择目标变量和特征变量。
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