shell win10 改成cmd_IBSimu在win10分系统ubuntu的安装和计算详细教程

在分享|国外一款用于离子束仿真的开源软件IBSimu一文中介绍了国外开源的一个程序包IBSimu，用来仿真离子源的引出过程，并且给出了安装过程，但是在实际操作过程中我发现使用msys2+mingw的方式总是出现问题，尝试了两天后依然没解决zlib库的问题，听朋友说在win10上安装ubuntu比较不错，于是尝试了这个，找到国外一个教程，发现还是有问题，果然菜是原罪，折腾了两天发现依然是环境配置有问题，今天下午找到我一个会linux的师弟，折腾了整整半天终于搞定了，我现在分享出来。首先是ubuntu的安装关于在windows系统上安装ubuntu的教程请看适用于 Linux 的 Windows 子系统安装指南 (Windows 10)，按照这个教程一步步操作就行，需要说明的一点是需要检查CPU是否开启的虚拟化，没有的话需要在bios界面开启虚拟化，结果如下图所示。开启bios虚拟化的过程请参考百度知道：电脑怎么在bios开启虚拟化。另一个需要注意的点是先更新windows系统，最好更新到最新的win10，在windows官方系统有说，我使用的是2004版本，win+R然后输入winver，确定后即可查看自己的系统版本。更新版本很费时间，我这边花了大半天时间。然后是在ubuntu上安装和编译IBSimu，详细过程如下：这是在国外一个安装教程的基础之上进行的修改。

安装库环境

以ubuntu环境为例，CentOS等是相似的。

sudo apt install libcairo2-devsudo apt install libgsl-devsudo apt install libgtk-3-devsudo apt install gcc

除了这些库，可能还需要gsl等，这个库无法直接安装，如何安装请看下文。下载IBSimu

git clone git://ibsimu.git.sourceforge.net/gitroot/ibsimu/ibsimu

编译

cd ibsimu./reconf./configure --prefix=`pwd`make -j4 ##4核或者8核，我这里用的4核make install

老外：你可能需要将“./configure”行中的前缀路径调整为下载存储库的文件夹，即更改‘’pwd‘注：pwd指令意为返回当前执行命令的目录，而`pwd`的意思是先运行pwd后把结果填上去，但是有的环境有可能不能这么写，比如在ubuntu下这个指令可以正常执行，但在一个全新的arch虚拟机里，就得写成./configure --prefix=/home/yyxc-1993/ibsimu在实际操作过程中，在./reconf这个环节遇到了一些问题这里显示库安装不全面，还有一些其他的库需要安装。按照上图提示，通过搜索包含相关库的源获取，然后安装。过程如下：对于ubuntu系统，可用apt-file包查询缺失的文件，用sudo apt install apt-file命令安装apt-file。

sudo apt install apt-file# 假设缺失的文件是cairo2sudo apt-file update# 第一次用要用update命令刷新缓存sudo apt-file search cairo2# 在返回的结果里，左侧一列是软件包名，右侧一侧是查找到的文件名，在软件包名中找一个看上去差不多的包安装(依赖装多了没关系)，例如libcairo2-dev这个sudo apt install libcairo2-dev

对于arch系统，由于其包管理系统更加健全，可直接安装报错中提到的包，例如

# ...checking for cos in -lm... yeschecking for LIBPNG... yeschecking for FONTCONFIG... yeschecking for FREETYPE... yesconfigure: error: required library cairo not found# 报错提示cairo包找不到sudo pacman -S cairo

这里还出现了另一个问题，如果环境配置好了还是无法通过编译，可能是由于之前configure命令导致配置出错，可以尝试重新git clone IBSimu库再执行编译的步骤。到这里，IBSimu的安装就完成了，接下来是如何做一个仿真案例。接下来遇到了路径的问题，我这里直接给出结果

环境变量设置

老外：在你编译任何项目之前，你必须设置好环境变量。下面是我在arch虚拟机里运行的结果，可以看到最终编译的结果被安放在了圈出来的位置。在之前的ubuntu虚拟机里，这个结果是/home/yyxc-1993/code/ibsimu/lib/pkgconfig现在，要设置两个环境变量，以便在以后的程序运行中让编译器能顺利找到本次安装的程序。你可以直接在终端里运行以下命令

export PKG_CONFIG_PATH="/home/yyxc-1993/code/ibsimu/lib/pkgconfig"export LD_LIBRARY_PATH="/home/yyxc-1993/code/ibsimu/lib"

如果你不想每次打开终端都输入一遍的话，往下看。老外：如果你想在任何时候打开一个新的控制台/终端，你可以把这些命令放到你的“.bashrc”中。首先找到当前路径：注：bash是linux的默认shell，每当你打开一个linux终端时，bash都会读取目录下.bashrc文件中的参数。你也可以输入source ~/.bashrc来立即让bash读取这个文件，而不用重新打开一个终端。注：如果你使用的不是bash，例如zsh，要更改的文件就是.zshrc

cdnano ~/.bashrc

老外：复制这两个路径放到最后并保存

export PKG_CONFIG_PATH="/home/yyxc-1993/code/ibsimu/lib/pkgconfig"export LD_LIBRARY_PATH="/home/yyxc-1993/code/ibsimu/lib"

注：这两个位置是根据编译最后一步的结果来定的，例如如果是我在arch虚拟机中的结果，这两句就是这样

export PKG_CONFIG_PATH="/home/xuwanqian/code/ibsimu/lib/pkgconfig"export LD_LIBRARY_PATH="/home/xuwanqian/code/ibsimu/lib"

makefile的设置

CC = g++LDFLAGS = `pkg-config --libs ibsimu-1.0.6dev`CXXFLAGS = -Wall -g `pkg-config --cflags ibsimu-1.0.6dev`vlasov2d: vlasov2d.o$(CC) -o vlasov2d vlasov2d.o $(LDFLAGS)vlasov2d.o: vlasov2d.cpp$(CC) -c -o vlasov2d.o vlasov2d.cpp $(CXXFLAGS)clean:$(RM) *~ *.o vlasov2d ##vlasov2d是cpp文件的文件名

设置好之后，直接在windows下建立一个test文件夹，然后建立一个txt文档，将名字改成makefile代码里面的同名文件，格式更改为.cpp，输入需要计算的模型代码(案例请看上一篇更新，直接复制即可)再建立一个空白txt文档，命名为makefile文档，删除.txt保存。然后采用记事本打开这个文档，复制上面的代码(按需修改)。然后在test文件夹空白处【shift+右键】【在此处打开linux shell】，输入make开始编译，最后再键入编译好的结果开始计算，我这里的命名是vlasov2d。

make./vlasov2d

至此完成计算。结果如下：