awk 以HWI开头,并且:相邻两行的第一个字段完全相同;

本文介绍了一种使用awk命令处理特定格式配对读段的方法。该方法针对以'HWI'开头并且相邻两行第一个字段相同的行进行处理,通过自定义开始块来存储上一行的内容,并判断当前行是否与上一行的第一个字段相同,如果相同则输出上一行和当前行。

## 思路:以HWI开头,并且:相邻两行的第一个字段完全相同;
awk 'BEGIN{ last_col_1="xxxxxx"; last_row="bbbbbbbbbbb";} $1 ~ /HWI/{ if($1 == last_col_1) {print last_row; print $0;} last_col_1=$1; last_row=$0;}' test_for_filter_pairedreads.txt > temp001.txt

转载于:https://www.cnblogs.com/emanlee/p/5391087.html

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值