in文件注意事项及详细解释（转载）

最新推荐文章于 2024-10-18 16:22:49 发布

转载

最新推荐文章于 2024-10-18 16:22:49 发布 · 1.6k 阅读

15 ·

CC 4.0 BY-SA版权

原文链接：http://www.cnblogs.com/sysu/p/10821217.html

文章标签：

#shell

本文详细介绍了LAMMPS分子动力学模拟中in文件的使用，包括初始化、原子定义、设置、模拟运行四个部分，强调了命令书写注意事项、单位系统、边界条件、力场类型等关键概念，并提供了各种命令的用途和示例。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

转载自:https://www.cnblogs.com/sysu/p/10817315.html 和 https://www.cnblogs.com/panscience/p/4953940.html

lammps做分子动力学模拟时，需要一个输入文件（input script），也就是in文件，以及关于体系的原子坐标之类的信息文件（data file）和势文件（potential file）。lammps在执行计算的时候，从这个in文件中读入命令，所以对LAMMPS的使用最主要的就是对in文件的编写和使用。

下面是in文件书写方面的注意事项以及对4个模块的详细解释，原文来源于百度文库：

http://wenku.baidu.com/view/152b56906bec0975f465e26a.html?re=view

由RCWDliwei于2014年4月13日上传。在转载并重新编排之前对原文作者表示致谢。

1、lammps命令分类整理

Initialization	atom_modify, atom_style, boundary,dimension, newton, processors, units
Atom definition	create_atoms, create_box, lattice, read_data, read_restart, region, replicate
Force fields	angle_coeff, angle_style, bond_coeff, bond_style, dielectric, dihedral_coeff, dihedral_style,improper_coeff, improper_style, kspace_modify, kspace_style, pair_coeff, pair_modify, pair_style, pair_write,special_bonds